Naslov
Identifikacija pasmine i autentifikacija proizvoda Crne slavonske svinje analizom DNK
(Breed identification and authentication of Black Slavonian pigs by DNA analysis)

Autori
Gvozdanović, Kristina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Fakultet agrobiotehničkih znanosti Osijek

Mjesto
Osijek

Datum
14.06

Godina
2017

Stranica
156

Mentor
Margeta, Vladimir

Ključne riječi
crna slavonska svinja ; mikrosateliti ; DNK ; združena PCR reakcija
(Black Slavonian pig ; microsatellites ; DNA ; multiplex PCR)

Sažetak
Istraživanje je provedeno na 107 životinja od kojih je bilo 50 svinja crne slavonske pasmine (CS), 15 PIC hibrida, 12 pietrena (P), 10 topigsa (TP), 10 velikih jorkšira (J), 5 landrasa (L) i 5 duroka (D). Od ukupno analiziranih 100 svinja crne slavonske pasmine kod kojih smo odredili genotip MC1R gena odabrano je 30 životinja homozigota za crnu boju (CS), te 20 životinja heterozigota (CSX). Cilj istraživanja bio je utvrditi genetski status crne slavonske svinje pomoću seta od 26 mikrosatelitska markera te optimizirati najmanji broj mikrosatelita dovoljnih za identifikaciju pasmine te autentifikaciju proizvoda načinjenih od iste. Prema preporuci ISAG-FAO odabran je set od 26 mikrosatelitna lokusa (S0026, S0155, S0005, Sw2410, Sw830, S0355, Sw24, Sw632, Swr1941, Sw936, S0218, S0228, Sw122, Sw857, S0097, sw240, IGF1, Sw2406, Sw72, S0226, S0090, Sw2008, Sw1067, S0101, S0178, Sw911 i S0002) grupirana u tri združene PCR reakcije. Dobiveni PCR produkti su analizirani pomoću ABI 3730XLs (Applied Biosystems). Analizom genetske strukture populacija utvrđena je niska genetska udaljenost između CS i CSX skupina, no visoka genetska udaljenost s ostalim pasminama. Analizom frekvencije gena identificirano je 15 privatnih alela specifičnih za skupinu crnih svinja homozigota na MC1R genu, te 10 privatnih alela specifičnih samo za heterozigote na MC1R genu. Prosječan broj alela po lokusu se kretao od 2, 61 do 6, 54 što ukazuje na veliku genetsku raznolikost. Optimizacijom broja mikrosatelitskih lokusa temeljenom na frekvenciji alela, broju privatnih alela, vrijednosti informacijskog sadržaja polimorfizma te izračunu vjerojatnosti identiteta utvrđen je set od pet markera koji su dovoljno informativni za identifikaciju pasmine i autentifikaciju proizvoda. Koristeći navedeni set moguće je identificirati crnu slavonsku pasminu od koje su proizvedeni proizvodi napravljeni od pojedinačnih životinja (šunka ili pršut), međutim identifikacija u kobasičarskim proizvodima nije izvediva zbog većeg broja životinja korištenih pri proizvodnji ovakvih proizvoda, što za ovaj tip analize i veliku polimorfnosti mikrosatelitskih markera nije pogodno.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija)

POVEZANOST RADA