аЯрЁБс>ўџ +-ўџџџ*џџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџьЅСG ПH bjbjŽйŽй ьГьГHџџџџџџ]&&&&&&&VVVVV b V/Жz:ДДДДД"ж тшъъъъъъ$хєй Ў!&ъДДъъT&&ДДzTTTъ&Д&Дш:H&&&&ъшT”Tш&&шДn РGfоФРVVќXшIvana Pleaa, Ivana Radoj i, }elimir Kurtanjek Escherichia coli metabolic network modelling Faculty of Food Technology and Biotechnology University of Zagreb Pierottijeva 6, 10000 Zagreb, CROATIA  HYPERLINK mailto:i_plesa@yahoo.com i_plesa@yahoo.com,  HYPERLINK mailto:ivana.radojcic@inet.hr ivana.radojcic@inet.hr,  HYPERLINK mailto:zkurt@pbf.hr zkurt@pbf.hr 01 3638 445, 01 6525 092, 01 4605 294 Ivana Pleša will present the paper in English language Key words: Escherichia coli, metabolic engineering, computer simulation This work presents mathematical model of Escherichia coli metabolism based on kinetic data and annotated genome information by J.S. Edwards(1). Published reaction rates and kinetic parameters are used for derivation of mass balances for the key metabolic networks. The balances are given in dynamic form, which enables simulation of transient metabolic behaviour under varying experimental conditions. Applied is stoichiometric analysis of reaction rate constraints. The computer model is based on a set of stiff nonlinear ordinary differential equations (ODE) with specified initial conditions. Applied is NDSolve numerical integration program for evaluation of the model equations. The results are presented in graphical form enabling visualisation of key metabolic pathways. The results are discussed with various published data from literature. 1. J.S. Edwards, Rafael U. Ibarra, and Bernhard O. Palsson, “ In silico predictions of Escherichia coli metabolic capabilities are consistent with experimental data”, Nature Biotechnology 19 (2001) 125 `€КМђє’кмо-./EFHIhijvwтђK[­АЙ Т в у ! 7 9 H ќіёюющсщощщжщощщЮщощЬЬЪЬЬЬШ5H*6jЊUjЫU0JjU jUmHCJ$mH  6CJ$mH 5>**^`КМDxžŸжз !іv w x y z { E F G H §§§њњњњњњњјјјјјѕѕјјјјјяјјј„7„Щ§$$^`КМDxžŸжз !іv w x y z { E F G H §§§А‚. АЦA!А"А# $ %АЫDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ i_plesa@yahoo.comрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ 2mailto:i_plesa@yahoo.comпDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ ivana.radojcic@inet.hrрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ <mailto:ivana.radojcic@inet.hrЗDаЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ  zkurt@pbf.hrрЩъyљКЮŒ‚ЊKЉ (mailto:zkurt@pbf.hr [(@ёџ(NormalCJmH <A@ђџЁ<Default Paragraph Font*>@ђ*Title$CJmH(U@Ђ( Hyperlink>*B*8V@Ђ8FollowedHyperlink>*B* Hџџџџ џџHH H H Шю.EHivHXџ€Xџ€Xџ€џџ _Hlt511703751tJuJ 0;<@ЂЎШFHwŸЄЅЊтэюђKVW[ПЭ%.ƒŠ–œЎЕМТвнотJ.fnШFHw ІЎJџџXXEC:\DOCUME~1\ADMINI~1\LOCALS~1\Temp\AutoRecovery save of Document1.asdXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXQC:\DOCUME~1\ADMINI~1\LOCALS~1\Temp\AutoRecovery save of Sazetak PrimMath_2001.asdXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXA:\Sazetak PrimMath_2001.docXXE:\Sazetak PrimMath_2001.docProf. Z. Kurtanjek5G:\Radovi\2001\PrimMath_01\Sazetak Ivana_Ivana_ZK.docџ@€˜ рH€€ @G‡ŸTimes New Roman5€Symbol3& ‡ŸArial"1ˆаhšsTЦšsTЦ“bT†б"ЅРДД€0dŸ­џџ.Ivana Pleaa, Ivana Radoj i, }elimir KurtanjekXXProf. Z. Kurtanjekўџр…ŸђљOhЋ‘+'Гй0˜˜амшє , H T ` lx€ˆт/Ivana Pleša, Ivana Radojшiц, Želimir Kurtanjek0vanXXnXnNormallProf. Z. KurtanjekR2ofMicrosoft Word 8.0R@@ђї9)УР@ќ3оФР@ќ3оФРўџеЭеœ.“—+,љЎDеЭеœ.“—+,љЎ\ hp|„Œ” œЄЌД М їтPBFj /Ivana Pleša, Ivana Radojшiц, Želimir Kurtanjek Titleє(RZВ _PID_GUID _PID_HLINKSтAN{0EE59FF0-B3F6-4780-81B6-54936F40A087}A8_gmailto:zkurt@pbf.hrP,mailto:ivana.radojcic@inet.hrmailto:i_plesa@yahoo.com ўџџџ ўџџџўџџџ !ўџџџ#$%&'()ўџџџ§џџџ,ўџџџўџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџRoot Entryџџџџџџџџ РFрTvянФР`Ђ˜оФР.€Data џџџџџџџџџџџџ 1TableџџџџWordDocumentџџџџSummaryInformation(џџџџџџџџџџџџDocumentSummaryInformation8џџџџџџџџ"CompObjџџџџџџџџџџџџjџџџџџџџџџџџџўџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџџўџ џџџџ РFMicrosoft Word Document MSWordDocWord.Document.8є9Вq