Naslov
Strukturna istraživanja enzima purinske nukleozidne fosforilaze iz bakterije Helicobacter pylori
(Structural investigation of enzyme purine nucleoside phosphorylase from bacteria Helicobacter pylori)

Autori
Papa, Lucija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
21.02

Godina
2017

Stranica
61

Mentor
Luić, Marija

Neposredni voditelj
Štefanić, Zoran

Ključne riječi
difrakcija rendgenskog zračenja na jediničnom kristalu ; formicin A ; fosfat ; Helicobacter pylori ; proteinska kristalografija ; purinska nukleozidna fosforilaza
(formycin A ; Helicobacter pylori ; phosphate ; protein crystallography ; purine nucleoside phosphorylase ; single-crystal X-ray crystallography)

Sažetak
Bakterija Helicobacter pylori, patogen ljudskog probavnog sustava, za biosintezu purinskih nukleozida koristi samo pomodni metabolički put. Smatra se da bi inhibicija ključnih enzima navedenog puta mogla inhibirati rast ove bakterije. Jedan od takvih enzima je purinska nukleozidna fosforilaza (PNP), koja katalizira fosforolitičko cijepanje glikozidne veze u purinskim nukleozidima. Kako bi se što bolje razumjelo vezanje liganada u aktivno mjesto PNP, pripremljeni su kristali binarnih kompleksa PNP s fosfatnim anionom, te s formicinom A - strukturnim analogom purinskog nukleozida adenozina, kao i kristali ternarnog kompleksa koji sadrži oba liganda. Trodimenzijske strukture kompleksa određene su metodom difrakcije rendgenskog zračenja na jediničnom kristalu. Vezanje fosfatnih aniona u aktivna mjesta enzima, koje je mogude samo u uvjetima snižene ionske jakosti, vjerojatno dovodi do konformacijske promjene u podjedinici i zatvaranja aktivnog mjesta. U otvorenim aktivnim mjestima konformacija formicina A razlikuje se od one u zatvorenim aktivnim mjestima. Navedeno je u skladu s trenutno pretpostavljenim katalitičkim mehanizmom za sličan PNP iz bakterije E. coli

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA