Pregled bibliografske jedinice broj: 966906
Phytoplasma DnaB, DnaG and SSB replisome proteins phylogeny reveals their complex evolutionary history
Phytoplasma DnaB, DnaG and SSB replisome proteins phylogeny reveals their complex evolutionary history // 13th Croatian Biological Congress Book of Abstracts / Kružić, Petar ; Caput Mihalić, Katarina ; Gottstein, Sanja ; Pavoković, Dubravko ; Kučinić, Mladen (ur.).
Poreč, Hrvatska, 2018. str. 102-103 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 966906 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Phytoplasma DnaB, DnaG and SSB replisome proteins phylogeny reveals their complex evolutionary history
Autori
Samaržija, Ivana ; Šeruga Musić, Martina
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
13th Croatian Biological Congress Book of Abstracts
/ Kružić, Petar ; Caput Mihalić, Katarina ; Gottstein, Sanja ; Pavoković, Dubravko ; Kučinić, Mladen - , 2018, 102-103
Skup
13. Hrvatski biološki kongres
Mjesto i datum
Poreč, Hrvatska, 19.09.2018. - 23.09.2018
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
Evolucija, filogenija, fitoplazme, potencijalne mobilne jedinice, replisom
(Evolution, phylogeny, phytoplasma, potential mobile unit, replisome)
Sažetak
Rod 'Candidatus Phytoplasma' obuhvaća unutarstanične bakterije bez stanične stijenke koje žive unutar biljnog floema i u stanicama kukaca koji su ujedno i njihovi prirodni vektori. Taksonomski, fitoplazme pripadaju razredu Mollicutes zajedno s aholeplazmama, mikoplazmama i srodnim bakterijama, a za razliku od spomenutih bakterija, nije ih moguće uzgajati u čistoj kulturi in vitro. Jedna od glavnih karakteristika njihovih malih i reduciranih genoma jest postojanje potencijalnih mobilnih jedinica (potential mobile units ; PMUs), genetičkih elemenata nalik transpozonima za koje se smatra da imaju ulogu u prilagodbi domaćinu. Replisomski geni, dnaB, dnaG i ssb, često se nalaze na takvim dijelovima genoma. U ovom radu izvršili smo opsežnu filogenetičku analizu DnaB, DnaG i SSB proteinskih sekvenci unutar članova razreda Mollicutes. Rezultati upućuju na složeno evolucijsko podrijetlo fitoplazmatskih replisomskih proteina s potencijalnih mobilnih jedinica. Analize sekvenci proteina DnaB pokazale su jasnu podjelu na dva klastera: DnaB1 i DnaB2, s dodatnim razdvajanjem PMU i ne-PMU sekvenci unutar DnaB1 klastera. Grupiranje sekvenci podrijetlom s PMU u zaseban klaster potvrđeno je i kod proteina DnaG i SSB. Dobiveni rezultati ukazuju na razdvojenu evoluciju PMU i ne-PMU replisomskih sekvenci, te česte rekombinacije i miješanje PMU gena između različitih fitoplazmatskih vrsta, što ovim bakterijama omogućava bolju prilagodbu i opstanak u različitim životnim uvjetima.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
POVEZANOST RADA
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
