Naslov
Kvaliteta molekule RNA izolirane iz uzoraka tkiva mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove
(Quality of RNA molecule isolated from bladder carcinoma samples embedded in paraffin blocks)

Autori
Županić, Katarina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Sveučilišni odjel zdravstvenih studija

Mjesto
Split

Datum
18.07

Godina
2018

Stranica
37

Mentor
Čikeš Čulić, Vedrana

Ključne riječi
Izolacija RNA ; karcinom mokraćnog mjehura ; parafinski blokovi
(RNA isolation ; bladder cancer ; paraffin blocks)

Sažetak
CILJ: FFPE uzorci su vrijedan izvor za istraživanje biomarkera karcinoma. Takve studije traže izolaciju nukleinske kiseline iz ograničenih količina uzoraka tkiva. Cilj ovog istraživanja jest procijeniti kvalitetu RNA molekule izolirane iz uzoraka tkiva karcinoma mokraćnog mjehura uklopljenih u parafinske blokove korištenjem GenElute FFPE RNA Purification kita (Sigma Aldrich). METODE: Koristili su se uzorci pacijenata koji su bili podvrgnuti transuretalnoj resekciji tumora mokraćnog mjehura i čiji su uzorci nakon patološke obrade uklopljeni u parafinske blokove. RNA se izolirala pomoću prije spomenutog kompleta, pridržavajući se uputa proizvođača. Šest je koraka u postupku izolacije:1. Deparafinizacija, 2. Priprema lizata, 3. Vezanje RNA na kolonu, 4. Dodatni korak uklanjanja DNA, 5. Ispiranje kolone te završni korak 6. Eluiranje RNA. Provjera koncentracije i čistoće RNA izvšila se spektrofotometrijskim testom na NanoDropu (Thermo Scientific NanoDrop Products) REZULTATI: Obrađeno je 36 uzoraka, od kojih 4 nisu prikladna za daljnje korištenje. Ostali uzorci zadovoljavaju kriterije koncentracije i čistoće RNA. Koncentracije iznad 30 ng/µL su uzete kao prihvatljive vrijednosti. Omjeri apsorbancija A260/A280 koji ukazuju na čistoću RNA u većine uzoraka su bili prihvatljivi uz minimalna odstupanja (1, 81-2, 06) ZAKLJUČCI: Korištenje Sigma's GenElute FFPE RNA Purification kompleta potvrdilo je početnu hipotezu. Ovaj komplet pruža mogućnost brze i jednostavne izolacije te donosi velike prinose i čistoću izolirane RNA.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Temeljne medicinske znanosti

POVEZANOST RADA