Naslov
Broj izvornih oplemenjivačkih populacija u germplazmi kukuruza Poljoprivrednoga instituta Osijek
(Number of founder breeding populations in maize germplasm of Agricultural institute Osijek)

Autori
Mario Franić, Vlatko Galić, Antun Jambrović, Tatjana Ledenčan, Zvonimir Zdunić, Ivan Brkić, Josip Brkić, Andrija Brkić, Domagoj Šimić

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
53rd Croatian and 13th international symposium on agriculture 2018 - Book of abstracts / Rozman V., Antunović Z. - Osijek, 2018, 76-77

Skup
53. hrvatski i 13. međunarodni simpozij agronoma

Mjesto i datum
Vodice, Hrvatska, 18.02.2018. - 23.02.2018

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija

Ključne riječi
populacija, genetika, SNP, STRUCTURE, genotipizacija
(population, genetics, SNP, STRUCTURE, genotyping)

Sažetak
Najčešća metoda mjerenja genetičke diferencijacije populacija je Wrightova F statistika. Njen nedostatak je što je za izračun potrebno unaprijed definirati populacije. Ukoliko to nije moguće potrebno je koristiti metode koje ne zahtijevaju unaprijed određenu strukturu. Jedna od tih metoda je korištenje softvera STRUCTURE koji razgraničava grupe jedinki na temelju njihovih genotipova na multiplim lokusima koristeći Bayesovski Markov Chain Monte Carlo pristup (5000 uhodavanja, 10000 prohoda). Cilj ovog istraživanja bio je odrediti broj izvornih oplemenjivačkih populacija u germplazmi kukuruza Poljoprivrednog instituta Osijek na temelju genotipizacije 343 primke (inbred linije) s 47430 SNP markera dobivenih pomoću MaizeSNP50 BeadChip čipa. Rezultati su pokazali da je najviša razina hijerarhije populacijske strukture koja je detektirana prema Evanno metodi jednaka 7 (ΔK = 5078.512). Prema rezultatima populacije su podijeljenje na: BSSS, Iodent, Lancaster, Oh43, Oh07, kokičar – tvrdunac i šećerac.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Poljoprivreda (agronomija)

POVEZANOST RADA