Naslov
Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda udaljenosti
(Distance-Based Phylogenetic Tree Construction Methods)

Autori
Gajski, Nikola

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
04.07

Godina
2017

Stranica
44

Mentor
Domazet-Lošo, Mirjana

Ključne riječi
filogenetsko stablo ; UGPMA ; metoda povezivanja susjeda ; matrica udaljenosti ; genom ; protein ; takson
(phylogenetic tree ; UGPMA ; neighbor joining method ; distance matrix ; gene ; protein ; taxon)

Sažetak
Izgradnja filogenetskog stabla kreće izračunom matrice udaljenosti. Udaljenosti se računaju po Jukes - Cantorovom modelu tako da se kao ulaz programa predaju poravnati genomi ili proteinski lanci u FASTA formatu. Nakon što je iz ulazne datoteke kreirana matrica udaljenosti, na temelju tih udaljenosti programska potpora omogućuje prikaz: matrice udaljenosti, filogenetskog stabla izgrađenog UPGMA metodom ili stabla izgrađenog metodom povezivanja susjeda.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo

POVEZANOST RADA