Pretraga

Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 933475

Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma

Široki, Tin
Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

CROSBI ID: 933475 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma
(Finding overlapping reads for de novo genome assembly)

Autori
Široki, Tin

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
05.07

Godina
2016

Stranica
40

Mentor
Domazet-Lošo, Mirjana

Ključne riječi
određivanje preklapanja, metoda preklapanje-razmještaj-konsenzus ; sastavljanje genoma ; prošireno sufiksno polje ; dinamičko programiranje
(finding overlaps, overlap-layout-consensus method ; genome assembly ; enhanced suffix array ; dynamic programming)

Sažetak
Određivanje preklapanja je prvi korak de novo sastavljanja genoma metodom preklapanje-razmještaj-konsenzus . Za određivanje preklapanja koristio sam kombinirani pristup. Pristup koristi prošireno sufiksno polje za pronalazak identičnih preklapanja i dinamičko programiranje za poravnanje dijelova očitanja između identičnih preklapanja. Ovakav način određivanja preklapanja omogućava kompromis između kvalitete određenih preklapanja i vremena izvođenja.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo



POVEZANOST RADA

Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb

Profili:

Avatar Url Mirjana Domazet Lošo (mentor)

Citiraj ovu publikaciju:

Široki, Tin
Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma, 2016., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
Široki, T. (2016) 'Određivanje preklapanja među očitanjima u postupku de novo sastavljanja genoma', diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {\v{S}iroki, Tin}, year = {2016}, pages = {40}, keywords = {odre\djivanje preklapanja, metoda preklapanje-razmje\v{s}taj-konsenzus, sastavljanje genoma, pro\v{s}ireno sufiksno polje, dinami\v{c}ko programiranje}, title = {Odre\djivanje preklapanja me\dju o\v{c}itanjima u postupku de novo sastavljanja genoma}, keyword = {odre\djivanje preklapanja, metoda preklapanje-razmje\v{s}taj-konsenzus, sastavljanje genoma, pro\v{s}ireno sufiksno polje, dinami\v{c}ko programiranje}, publisherplace = {Zagreb} }
@phdthesis{phdthesis, author = {\v{S}iroki, Tin}, year = {2016}, pages = {40}, keywords = {finding overlaps, overlap-layout-consensus method, genome assembly, enhanced suffix array, dynamic programming}, title = {Finding overlapping reads for de novo genome assembly}, keyword = {finding overlaps, overlap-layout-consensus method, genome assembly, enhanced suffix array, dynamic programming}, publisherplace = {Zagreb} }

Podijeli:





Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font
CROSBI koristi kolačiće (cookies) kako bi poboljšao funkcionalnost stranice.