Naslov
Algoritam straničenja velike baze podataka genoma
(Algorithm for Paging Large-Scale Genome Database)

Autori
Stjepanović, Mateo

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
03.07

Godina
2017

Stranica
25

Mentor
Domazet-Lošo, Mirjana

Ključne riječi
straničenje, baza podataka, Kraken, metagenom, k-mer, LCA, minimizer
(paging, database, Kraken, metagenom, k-mer, LCA, minimizer)

Sažetak
Straničenje velike baze podataka se odvija u dva koraka. Prvi je podjela baze podataka na manje cjeline (baze podataka manjeg memorijskog kapaciteta). On je ostvaren pomoću bash skripte koja, uz sqlite3 naredbe, uspijeva napraviti kostur originalne baze te SQL upite za punjenje baze podacima. Drugi korak je samo straničenje koje iterira po svim bazama te traži podatak koji želimo obraditi. Za nastavak i poboljšanje straničenja može se uvesti lista indeksa baza podataka te se jednostavnim pretraživanjem liste može utvrditi samo jedna baza podataka koju trebamo učitati.

Izvorni jezik
Hrvatski

POVEZANOST RADA