Pregled bibliografske jedinice broj: 922796
Mehanizam diskriminacije prirodnih proteinogenih i neproteinogenih nepripadnih aminokiselina kod aminoacil-trna-sintetaza razreda IA
Mehanizam diskriminacije prirodnih proteinogenih i neproteinogenih nepripadnih aminokiselina kod aminoacil-trna-sintetaza razreda IA, 2016., doktorska disertacija, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 922796 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Mehanizam diskriminacije prirodnih
proteinogenih i neproteinogenih nepripadnih
aminokiselina kod aminoacil-trna-sintetaza
razreda IA
(Mechanism of discrimination of natural
proteinogenic and nonproteinogenic amino acids
in class IA aminoacyl-tRNA synthetases)
Autori
Biluš, Mirna
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
22.12
Godina
2016
Stranica
129
Mentor
Gruić-Sovulj, Ita
Ključne riječi
izoleucil-tRNA-sintetaza ; valil-tRNA-sintetaza ; leucil-tRNA-sintetaza ; mistranslacija ; norvalin ; popravak pogreške
(isoleucyl-tRNA synthetase ; valyl-tRNA synthetase ; leucyl-tRNA synthetase ; mistranslation ; norvaline ; proofreading)
Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze kataliziraju vezanje aminokiselina na 3'-kraj tRNA u reakciji koja se sastoji od dva koraka: prvo dolazi do aktivacije aminokiseline uz pomoć ATP-a pa nastaje aminoacil-adenilat, a zatim do prijenosa aktivirane aminokiseline na 3'- kraj tRNA. Strukturna sličnost aminokiselinskih supstrata i potreba za točnošću reakcije aminoaciliranja uvjetovale su postojanje mehanizama popravka pogrešaka aminoacil-tRNA- sintetaza: popravak se može odvijati prije i poslije prijenosa na tRNA. U ovoj disertaciji istraženi su mehanizmi diskriminacije enzima izoleucil- i valil-tRNA- sintetaze iz bakterije Escherichia coli prema prirodnoj neproteinogenoj aminokiselini norvalinu. IleRS uspješno aktivira norvalin i prenosi ga na tRNAIle, a popravak se vrši prije prijenosa i većim dijelom nakon prijenosa na tRNA. Kao što je to prethodno pokazano za valin, IleRS koristi, uz tRNA-neovisni, i tRNA-ovisni popravak pogreške prije prijenosa za uklanjanje norvalina. Potonji mehanizam je svojstven IleRS i nije dokumentiran kod drugih enzima klase Ia. Norvalin je 3 do 4 puta toksičniji od valina bakteriji E. coli koja eksprimira IleRS s ugašenim popravkom pogreške nakon prijenosa. ValRS slabo aktivira norvalin, pa se već u prvom koraku reakcije aminoaciliranja postiže diskriminacija dovoljna za očuvanje točne biosinteze proteina. Ipak, aktivirani norvalin se efikasno prenosi na tRNAVal, a ako dođe do prijenosa uklanja se popravkom pogreške nakon prijenosa.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija, Biologija
POVEZANOST RADA
Projekti:
--09.01/293 - Nekanonske uloge aminoacil-tRNA-sintetaza (Gruić-Sovulj, Ita; Weygand Đurašević, Ivana) ( CroRIS)
HRZZ-UKF 8/15 - The origin of amino acid specificity in editing class I aminoacyl-tRNA synthetases and cellular requirements for proofreading (Gruić-Sovulj, Ita, HRZZ ) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb