Naslov
In silico probir derivata kumarina i L- askorbinske kiseline na histonskoj demetilazi LSD1 — pametni dizajn novih kemoterapeutika
(In silico screening of coumarin and L-ascorbic acid derivatives on histone demethylase LSD1 - rational design of novel chemotherapeutics)

Autori
Ister, Rok

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Mjesto
Zagreb

Datum
13.07

Godina
2018

Stranica
52

Mentor
Verbanac, Donotella

Neposredni voditelj
Stepanić, Višnja

Ključne riječi
askorbinska kiselina ; in silico ; kemoterapija ; kumarin ; lizin-specifična demetilaza 1 ; molekularno uklapanje ; virtualni probir
(ascorbic acid ; chemotherapy ; coumarin ; in silico studies ; lysine-specific demetilaze 1 ; molecular docking ; virtual screening)

Sažetak
Razvoj novih lijekova podrazumijeva dugotrajan i skup proces. Uključivanje stručnjaka iz svih područja omogućuje smanjivanje rizika od gubitka potencijalno kvalitetnih molekula tijekom tog procesa, te su danas interdisciplinarni timovi imperativ za osiguravanje uspješnosti i brzine odvijanja samog tijeka istraživanja i razvoja novih terapijskih opcija. Budući da je razvoj novih tehnologija i kompjuterskih/računskih programa omogućio relativno uspješno predviđanje ponašanja molekula u biološkim sustavima, te je doprinio i ukupnom smanjenju troškova razvoja, upotreba računalne kemije danas je od velikog značaja i uvelike se koristi u farmaceutskoj industriji i u ostalim sustavima koji se bave problematikom iznalaženja novih obećavajućih molekula. U ovom radu je sa skupom novosintetiziranih hibridnih spojeva (33 kumarinsko-1, 2, 3- triazolna i 61 askorbinsko -1, 2, 3-triazolna derivata) provedeno molekularno uklapanje na poznatoj ciljnoj molekuli enzimu, LSD1 (lizin- specifičnoj demetilazi 1) kako bi se između navedenog skupa spojeva probrale aktivne molekule i pokušao pretpostaviti mehanizam njihove inhibicije ciljanog enzima koji sudjeluje u epigenetskoj regulaciji stanice. LSD1 igra vrlo važnu ulogu u modifikaciji epigenetskog izražaja stanice uklanjajući metilne skupine s lizina na histonskim podjedinicama i pojačano je izražen u neoplastičnim stanicama određenih vrsta tumora. Model je postavljen koristeći poznate reverzibilne inhibitore LSD1 i pomoću određenih graničnih vrijednosti između aktivnih i neaktivnih spojeva probran je podskup spojeva za daljnja in vitro testiranja. Također, metodom definicije dva vezna mjesta predloženi su strukturni mehanizmi inhibicije otvarajući time mogućnost pametnog dizajniranja novih lijekova u bliskoj budućnosti koji ciljaju na enzim LSD1 kao mjesto djelovanja.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Temeljne medicinske znanosti, Farmacija

POVEZANOST RADA