Naslov
Stabilnost i strukturna karakterizacija proteina FlgD iz bakterije Helicobacter pylori
(Stability and structural characterization of the FlgD protein from Helicobacter pylori)

Autori
Stojanović, Mario

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.02

Godina
2016

Stranica
50

Mentor
Matković-Čalogović, Dubravka

Neposredni voditelj
Kekez, Ivana

Ključne riječi
humani patogen ; pročišćavanje proteina ; kristalizacija proteina ; rentgenska strukturna analiza ; struktura proteina
(human pathogen ; protein purification ; protein crystallization ; X-ray diffraction ; protein structure)

Sažetak
Protein FlgD bakterije Helicobacter pylori (HpFlgD) šaperon je koji igra ulogu tijekom sastavljanja kuke biča. Kuka biča dio je aparata za pokretanje koji je ujedno i faktor virulencije u ove bakterije. Bakterije koje su mutanti i nemaju tog proteina daju fenotipski nepokretne bakterije što govori da je njegova funkcija vrlo bitna prilikom sinteze kuke biča. Ovaj rad opisuje transformaciju bakterija Escherichia coli vektorom s ugrađenim genom proteina HpFlgDHis6, prekomjernu ekspresiju, pročišćavanje afinitetnom kromatografijom i gel filtracijom, postavljanje kristalizacije s čistim uzorkom proteina i rješavanje kristalne strukture proteina. Tijekom kristalizacije korišteni su uvjeti u kojima je variran udio (w/v) PEG 1500, pH pufera SPG, temperatura (4 °C i 16 °C) i koncentracija proteina. Podatci dobiveni rentgenskom strukturnom analizom kristala proteina HpFlgD dali su strukturni model do rezolucije od 2, 86 Å. Riješena struktura je pokazala da je protein građen iz dvije domene, Tudor i Fn III, koje su sastavljene od beta ploča i petlji. Struktura je slična dvijema poznatim strukturama proteina, FlgD iz bakterija Xanthomonas campestris i Pseudomonas aeruginosa. Ključna razlika između već poznatih struktura i ove jest zarotirani položaj domene Tudor.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA