Naslov
Modeliranje strukture i reaktivnosti organskih molekula novom klaster-kontinuum metodom solvatacije
(Modeling the structure and reactivity of organic compounds using a new cluster-continuum solvation method)

Autori
Rončević, Igor

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
30.06

Godina
2015

Stranica
140

Mentor
Mihalić, Zlatko

Ključne riječi
fragmentacijske metode (EFP) ; klaster-kontinuum metoda ; ravnoteža u otapalu ; reakcijski mehanizam ; solvatacija ; solvatacijske sfere ; teorija funkcionala gustoće
(cluster-continuum ; density functional theory (DFT) ; equilibrium in solution ; fragmentation methods (EFP) ; reaction mechanism ; solvation ; solvation spheres)

Sažetak
U ovoj disertaciji predstavljena je i primijenjena nova klaster-kontinuum metoda za opis solvatacije. U odnosu na postojeće, ova metoda uvodi novi pristup generiranju klastera na način da se solutu dodaju najvažnije molekule otapala. Pristup se temelji na konceptu solvatacijskih sfera funkcionalnih skupina. Radijusi solvatacijskih sfera dobivaju se analizom radijalnih funkcija raspodjele molekula otapala oko funkcionalnih skupina soluta, što omogućuje eliminaciju molekula otapala koje nisu potrebne za točan opis solvatacije. Nakon toga, daljnja analiza vrši se usporedbom interakcijskih energija preostalih molekula otapala. Predstavljena metoda omogućuje jednostavno, efikasno i nepristrano dobivanje geometrija s određenim brojem molekula otapala. Testiranje metode provedeno je na dva modelna sustava u vodi. Analizom dobivenih geometrija identificirani su obrasci vezanja nabijenih i neutralnih vrsta s molekulama vode, dok su dobivene energije, utežene Boltzmannovom raspodjelom, dale vrijednosti termodinamičkih veličina u odstupanju od 1 kcal/mol od eksperimentalnih. Nakon toga, metoda je iskorištena za istraživanje mogućih reakcijskih mehanizama hidrolize acetil-klorida.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA