Naslov
Mehanizmi popravka pogreške leucil-tRNA- sintetaze sprječavaju nekanonsku mistranslaciju proteoma bakterije Escherichia coli
(Proofreading activities of leucyl-tRNA synthetase prevent noncanonical mistranslation of the Escherichia coli proteome)

Autori
Cvetešić, Nevena

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
18.03

Godina
2015

Stranica
145

Mentor
Gruić-Sovulj, Ita

Ključne riječi
elongacijski faktor Tu ; leucil-tRNA-sintetaza ; mikroaerobni uvjeti ; mistranslacija ; norvalin ; popravak pogreške
(elongation factor Tu ; leucyl-tRNA synthetase ; micro-aerobic conditions ; mistranslation ; norvaline ; proofreading)

Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS) su enzimi koji kataliziraju povezivanje aminokiseline i tRNA. Povezivanje isključivo pripadnog para presudno je za točnu biosintezu proteina. AaRS koje nisu dovoljno specifične za pripadnu aminokiselinu imaju složene mehanizme popravka vlastitih pogrešaka. Popravak se može odvijati prije (hidroliza aminoacil-adenilata) ili nakon prijenosa aminokiseline na tRNA (hidroliza misacilirane tRNA). U ovoj disertaciji detaljno su okarakterizirane sintetska i hidrolitičke reakcije leucil-tRNA-sintetaze (LeuRS) iz bakterije E. coli. Pokazano je da LeuRS ne koristi tRNA-ovisan popravak pogreške prije prijenosa i da pogreške uklanja kroz hidrolizu misacilirane tRNA. Izoleucin je u literaturi istaknut kao dobar supstrat LeuRS koji ugrožava točnost dekodiranja leucinskih kodona. Kinetički eksperimenti pokazuju da LeuRS u sintetskoj reakciji učinkovito isključuje izoleucin, zbog čega popravak pogreške nema ulogu u sprječavanju mistranslacije leucinskih kodona izoleucinom. Nedavno je pokazano da se norvalin, neproteinogena aminokiselina, nakuplja u bakterijskoj citoplazmi u uvjetima nedostatka kisika. Rezultati ove disertacije pokazuju da je glavna biološka funkcija hidrolitičkog popravka LeuRS isključivanje norvalina iz genetičkog koda. Kroz ovo istraživanje otkrivena je poveznica popravka pogreške LeuRS i mehanizama prilagodbe bakterija na rast u uvjetima sa smanjenom količinom kisika

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA