Naslov
Seril-tRNA-sintetaza iz biljke Arabidopsis thaliana: stanična lokalizacija i priprema skraćenih varijanti proteina
(Seryl-tRNA synthetase in plant Arabidopsis thaliana: cellular localization and preparation of truncated protein variants)

Autori
Šarić, Ela

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27.02

Godina
2015

Stranica
117

Mentor
Rokov Plavec, Jasmina ; Mrvoš-Sermek, Draginja

Neposredni voditelj
Kekez, Mario

Ključne riječi
aminoacil-tRNA-sintetaza ; seril-tRNA-sintetaza ; BEN1 ; ekspresija proteina ; stanična lokalizacija ; poučavanje kemije ; učenje otkivanjem ; vitamin C
(aminoacyl-tRNA synthetase ; seryl-tRNA synthetase ; BEN1 ; protein expression ; cellular localization ; teaching chemistry ; experiential learning ; vitamin C)

Sažetak
Ovaj diplomski rad sastoji se od istraživačkog i metodičkog dijela. U sklopu istraživačkog dijela, konstruirani su skraćeni oblici proteina seril- tRNA-sintetaze (SerRS) i BEN1 s ciljem utvrđivanja domena odgovornih za njihovu interakciju. SerRS pripada porodici aminoacil- tRNA-sintetaza (aaRS), ključnih enzima koji sudjeluju u translaciji pridruživanjem pripadnih aminokiselina odgovarajućim tRNA. Posljednjih desetljeća, sve je više otkrića o ulogama aaRS u različitim staničnim procesima izvan translacije koje se najčešće ostvaruju interakcijom s drugim proteinima pa se te interakcije intenzivno proučavaju. Nedavno je kao proteinski partner citosolne SerRS iz biljke Arabidopsis thaliana identificiran BEN1, protein koji sudjeluje u metabolizmu biljnih hormona brasinosteroida. Budući da brasinosteroidi sudjeluju u odgovoru biljke na stres, postoji mogućnost da i SerRS sudjeluje u odgovoru biljke na stres interakcijom s BEN1 što čini istraživanje njihove interakcije iznimno zanimljivim. Optimirani su različiti uvjeti ekspresije za navedene skraćene proteine, a uspješno eksprimirani proteini su pročišćeni afinitetnom kromatografijom na Ni- NTA koloni. Određen je unutarstanični smještaj SerRS fuzionirane sa zelenim fluorescentim proteinom na C-kraju proteina. Iako C-kraj SerRS sadrži potencijalni signal za lokalizaciju u jezgri, protein je smješten u citosolu. U metodičkom dijelu rada pod naslovom "Učeničko istraživanje utjecaja različitih čimbenika na raspad vitamina C" naveden je prijedlog za nastavni sat primjeren učenicima četvrtog razreda gimnazije. Predložen je jednostavan pokus za koji je detaljno razrađen radni listić za učenike i uputa za nastavnike. Prijedlog se temelji na vlastitom istraživanju o utjecaju različitih čimbenika na raspad vitamina C.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA