Naslov
Dokazivanje i filogenetska analiza norovirusa izdvojenih iz školjkaša s proizvodnih područja u Republici Hrvatskoj
(Detection and phylogenetic analysis of norovirus from bivalve molluscs at production areas in the Republic of Croatia)

Autori
Škoko, Ines

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Veterinarski fakultet

Mjesto
Zagreb, Hrvatska

Datum
08.01

Godina
2015

Stranica
151

Mentor
Kozačinski, Lidija

Neposredni voditelj
Lojkić, Ivana

Ključne riječi
norovirus; školjkaši; filogenetska analiza; Hrvatska
(norovirus; shellfish; phylogenetic analysis; Croatia)

Sažetak
Norovirus je jedan od vodećih uzročnika epidemijskih i sporadičnih slučajeva gastroenteritisa u svijetu. Bioakumulira se u školjkašima koji su poznati kao prijenosnik humanih patogena, unatoč regulativi baziranoj na E. coli (<230 MPN).Svrha ovog istraživanja je procjena prisutnosti norovirusa u školjkašima podrijetlom s hrvatskih proizvodnih područja. Uzorci hepatopankreasa školjkaša su pretraženi real-time RT-PCR uz dodatak procesne kontrole (mengovirus). Ukupno je analizirano 443 uzorka s zadovoljavajućom efikasnošću ekstrakcije. Norovirus je utvrđen u 47 uzoraka obje genogrupe, s znatno većom reprezentacijom GII pozitivnih uzoraka (78%), nego GI (22%). Prevalencija norovirusa je 10, 61%. Norovirus je utvrđen na četiri proizvodna područja ; Ušće rijeke Krke, Kanal sv. Ante, Kaštelanski zaljev i Malostonski zaljev. Uočena je sezonska varijacija nivoa NoV s najvećim brojem pozitivnih uzoraka u prosincu, siječnju i veljači. Filogenetskom analizom nukleotidnog slijeda ORF2 odsječka utvrđena su dva genotipa NoV GII u uzorcima školjkaša GII.4 i GII.3. Analizirano je i sedam uzoraka stolice ljudi u kojima je utvrđen NoV GI i GII, a filogenetskom analizom ORF2 odsječka utvrđen je GII.2 i GII.4 koji je 100% identičan u usporedbi s izolatom Hu/GII.4/sydney/NSW05.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Javno zdravstvo i zdravstvena zaštita, Veterinarska medicina

POVEZANOST RADA