Naslov
Značaj komparativne genomike u otkrivanju novih seril-tRNA-sintetaza i srodnih enzima
(The role of comparative genomics in discovery of novel seryl-tRNA synthetases and related enzymes)

Autori
Močibob, Marko ; Simunović, Vesna ; Lesjak, Sonja ; Weygand-Đurašević, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, ostalo

Izvornik
Zbornik radova sa znanstvenog skupa Bioinformatika i biološka fizika, HAZU / Akademik Vladimir Paar - Zagreb : Hrvatska akademija znanosti i umjetnosti (HAZU), 2013, 217-236

ISBN
978-953-154-199-2

Skup
Bioinformatika i biološka fizika

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 21.11.2013

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Nije recenziran

Ključne riječi
aminoacil-tRNA-sintetaze; komparativna genomika; filogenetska analiza; homolozi aminoacil-tRNA-sintetaza; biosinteza proteina; neribosomska sinteza peptida; aminokiselina:(protein-nosač)-ligaza; protein-nosač
(( aminoacyl-tRNA synthetase; comparative genomics; phylogenetic analysis; aminoacyl-tRNA synthetase homologs; protein biosynthesis; non-ribosomal peptide synthesis; amino acid: (carrier protein)-ligase; carrier protein ))

Sažetak
Aminoacil-tRNA-sintetaze (aaRS) su neophodni enzimi za život svake stanice. Kataliziraju esterifikaciju transfer RNA pripadnim aminokiselinama, a nastale aminoacil-tRNA potom sudjeluju u biosintezi proteina na ribosomu. Zbog esencijalne uloge i prisustva u svim organizmima smatra se da su se aaRS pojavile među prvim enzimima pri nastanku života. Jedna aaRS je specifična za jednu aminokiselinu i jednu porodicu tRNA-izoakceptora s antikodonom za dotičnu aminokiselinu. Postoji velika sličnost među aaRS iz različitih organizama koje aktiviraju istu aminokislinu. Ipak, genomske i filogenetske analize ukazale su na postojanje osebujnih predstavnika ove, inače konzervirane skupine enzima. Primjer su seril-tRNA-sintetaze (SerRS) metanogenog tipa, koje su zastupljene samo u metanogenim arhejama. Kristalografski i biokemijski studiji potvrdili su njihovu atipičnu strukturu i drugačiji mehanizam djelovanja. Još neobičniji homolozi atipičnih SerRS otkriveni su u mnogim bakterijama na temelju genomske analize. Ti su enzimi krnji i nedostaje im čitava regija za vezanje tRNA. Umjesto tRNA aminoaciliraju male proteine (tzv. protein-nosače ; CP) koji imaju kovalentno vezanu fosfopanteteinsku prostetičku skupinu te djeluju kao aminokiselina:CP-ligaze. Analiza genomskih okolina za aa:CP-ligaze i pripadne protein-nosače (CP) pomaže u otkrivanju biokemijskih putova u kojima sudjeluju novootkriveni proteini.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA