Naslov
Moć jakog zasjenjenja magnezijevih protuiona: DNA ostaje u konformacij dvostruke uzvojnice i u granici niske slanosti
(The power of magnesium counterion screening: DNA stays in a double stranded conformation even in the low salt limit)

Autori
Grgičin, Danijel ; Dolanski Babić, Sanja ; Ivek, Tomislav ; Tomić, Silvia

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Knjiga sažetaka 8. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva / Požek, Miroslav, Ban, Ticijana ; Bilušić, Ante ; Dominis Prester, Predrag ; Gajović, Andrea ; Kumerički, Krešimir ; Kurečić, Ivana ; Pavin, Nenad ; Radolić, Vanja ; Szilner, Suzana ; Tutiš, Eduard - Zagreb : Hrvatsko fizikalno društvo, 2013, 41-41

ISBN
978-953-7178-15-4

Skup
8. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

Mjesto i datum
Primošten, Hrvatska, 06.10.2013. - 08.10.2013

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Nije recenziran

Ključne riječi
DNA; korelacijuska duljina; dielektrična spektroskopija
(DNA; correlation length; dielectric spectroscopy)

Sažetak
Prethodno je izučavan utjecaj jednovalentnih natrijevih protuiona na stabilnost dvostruke uzvojnice DNA[1]. Velika gustoća naboja, 1e- /0.34nm, pojedinog lanca DNA uzrokuje repulziju među njima koja je u kompeticiji s privlačnim vodikovim vezama i slaganjem baza (eng. base stacking). Bez zasjenjenja protuionima iz otopine repulzija bi dominirala te bi došlo do razdvajanja lanaca-denaturacije. Očekuje se da dvovalentni magnezijevi protuioni uslijed jačeg zasjenjenja više smanjuju repulziju među lancima DNA te čine konformaciju dvostruke uzvojnice stabilnijom nego jednovalentni natrijevi protuioni. Eksperimentalno smo to i pokazali izmjerivši različite koncentracijske ovisnosti karakterističnih skala. Jedna od njih je i korelacijska duljina koja govori o udaljenosti međusobno isprepletenih lanaca DNA u otopini. Ona ukazuje da Mg protuioni čuvaju DNA u konformaciji dvostruke uzvojnice sve do najniže koncentracije na kojoj je eksperiment proveden, 0.01 mM. Istovremeno s Na protuionima DNA već za koncentraciju od 0.3 mM pokazuje dinamičko otvaranje[1]. Uzorke Mg-DNA smo pripremili dijalizom Na-DNA (Sigma D1626) prosječne duljine 4000 nm prema MgCl_2. Uzorci su karakterizirani induktivno vezanom plazmom- emisijom atomskih spektara ICP- AESom, te UV spektrofotometrijom. Dielektrična spektroskopija u rasponu frekvencija od 100Hz-100 MHz je napravljena na uzorcima u rasponu koncentracije 0.01 mM- 5 mM u čistoj vodi te u dodanoj soli. 1. S Tomić, S. Dolanski Babić, T. Vuletić, S. Krča, D. Ivanković, L. Griparić, R. Podgornik, Phys. Rev. E 75, 021905 (2007).

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Fizika, Biologija

POVEZANOST RADA