Naslov
FPGA implementacija Smith-Waterman algoritma
(FPGA implementation of Smith-Waterman algorithm)

Autori
Škugor, Danijela

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
15.07

Godina
2013

Stranica
47

Mentor
Vučić, Mladen

Ključne riječi
programabilna logička polja; FPGA; Smith-Waterman
(field programmable gate arrays; FPGA; Smith-Waterman)

Sažetak
Predložena je sklopovska implementacija Smith-Waterman algoritma. Model sklopovlja razvijen je u jeziku VHDL, te je optimiran za implementaciju na programabilnim logičkim poljima (FPGA) familije Virtex-6 proizvođača Xilinx, Inc. Posebna pažnja posvećena je brzini rada. Uhodano je sučelje za komunikaciju FPGA razvojnog sustava s osobnim računalom preko PCI sabirnice te je integrirano sučelje sa sklopovljem Smith-Waterman algoritma. Razvijeno je odgovarajuće ispitno okruženje, provedena simulacija, te je sustav ispitan u radu sa stvarnim podacima.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Elektrotehnika

POVEZANOST RADA