Naslov
Točnost popravka DNA u stanicama bakterije Deinococcus radiodurans nakon gama-zračenja
(Fidelity of DNA repair in gamma-irradiated cells of Deinococcus radiodurans)

Autori
Repar, Jelena

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
25.09

Godina
2012

Stranica
119

Mentor
Zahradka, Ksenija

Ključne riječi
Deinococcus radiodurans ; gama-zračenje ; dvolančani lomovi DNA ; točnost popravka DNA ; protein RecA ; očuvanost poretka gena
(Deinococcus radiodurans ; gamma-radiation ; double-strand DNA breaks ; fidelity of DNA repair ; RecA protein ; gene order conservation)

Sažetak
Bakterija Deinococcus radiodurans preživljava ekstremno visoke doze gama-zračenja koje cijepaju stanični genom u stotine fragmenata. Ova izuzetna otpornost posljedica je učinkovite zaštite proteina od oksidativnog stresa te učinkovitog i točnog popravka fragmentirane molekule DNA. U ovom radu pokazano je da točnost popravka DNA i stabilnost genoma bakterije D. radiodurans nakon gama-zračenja, a i tijekom normalnog staničnog rasta, ovisi o prisutnosti funkcionalnog proteina RecA. U njegovoj odsutnosti (tj. u mutantima recA), nastaju veliki rearanžmani genoma koji su, vjerojatno, posljedica nepreciznog RecA-neovisnog mehanizma popravka DNA. Pronađeno je da mutacija u genu recO dodatno povećava učestalost rearanžmana genoma u mutantima recA, što ukazuje na ulogu proteina RecO u RecA-neovisnom popravku DNA kod bakterije D. radiodurans. Rekonstrukcija genoma nakon gama-zračenja u bakteriji Escherichia coli pokazala je neočekivano visoku razinu točnosti. Paralelno, bioinformatičkom analizom pokazano je da očuvanost poretka gena (sintenija) ne odražava ekstremnu sposobnost popravka DNA u bakterijama roda Deinococcus. Gubitak sintenije veći je u bakterijama otpornim nego u bakterijama neotpornim na zračenje unutar skupine Deinococcus-Thermus.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA