Pregled bibliografske jedinice broj: 554892
Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrste Quecus robur (L.) i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch)
Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrste Quecus robur (L.) i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch), 2011., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 554892 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Utjecaj abiotičkog stresa na ukupnu genomsku i specifičnu metilaciju rDNA vrste Quecus robur (L.) i Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch)
(Effects of abiotic stress on level of global genome and specific rDNA methylation in Quercus robur (L.) and Lilium bosniacum (Beck) Beck ex Fritsch))
Autori
Ivona Bečeheli
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
17.03
Godina
2011
Stranica
90
Mentor
Vlatka Zoldoš
Neposredni voditelj
Ivan Biruš
Ključne riječi
CRED-RA; IGS; metilacija; polimorfizam; RAPD
(CRED-RA; IGS; methylation; polymorphism; RAPD)
Sažetak
Biljke, kao sesilni organizmi koji ne mogu izbjeći stres, razvile su efikasne kratkoročne strategije za adaptaciju na promjene u okolišu koje se najviše odnose na brze promjene u ekspresiji gena putem epigenetičkih mehanizama. U ovom diplomskom radu istraživane su epigenetičke promjene u dvije vrste, hrastu lužnjaku i bosanskom ljiljanu, i to u populacijama trajno izloženim abiotičkom stresu uslijed promjena staništa. Upotrebom metode CRED-RA (Coupled Restriciton Enzyme Digestion-Random Amplification) analizirana je razina ukupne genomske metilacije DNA te metilacije specifičnog rDNA genomskog područja. U genomu bosanskog ljiljana, između stresne i kontrolne populacije, utvrđena je značajna razlika u učestalosti polimorfizama nastalih zbog metilacijskih događaja. Zbog izrazito visoke intra-populacijske genetičke varijabilnosti hrasta lužnjaka, metoda CRED-RA se pokazala nedovoljno preciznom za utvrđivanje metilacijskih događaja na populacijskoj razini. Metodom RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), utvrđen je veći broj polimorfizama DNA u genomu populacija izloženih stresu obiju istraživanih vrsta., . Analiza specifične metilacije rDNA genomskog područja otkrila je hipermetiliranost rDNA sustava hrasta lužnjaka. Usporedbom CRED-RA obrasca specifične metilacije i restrikcijske mape za 18S-26S rRNA podjedinicu ove vrste pronađena su 4 hipometilirana mjesta unutar intergenske razmaknice čija je funkcija regulacija transkripcije ovih gena.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
