Naslov
Fizikalna svojstva koja razlikuju peptide antibiotike od peptida toksina
(Physical properties distinguishing peptide antibiotics from toxic peptides)

Autori
Sanader, Željka

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu

Mjesto
Split

Datum
22.10

Godina
2009

Stranica
24

Mentor
Juretić, Davor

Ključne riječi
antimikrobni peptidi; hidrofobnost; peptidni antibiotici; peptidi toksini
(antimicrobial peptides; hydrophobicity; peptide antibiotics; peptide toxins)

Sažetak
Zbog rastuće otpornosti bakterija na standardne antibiotike, postalo je bitno pronaći nove antimikrobne supstance s novim načinima djelovanja. Antimikrobni peptidi se čine obećavajućim rješenjem tog problema. Provode se mnoga istraživanja s ciljem razumijevanja načina na koji djeluju. Iako nije do kraja razjašnjen mehanizam kojim uništavaju bakterije, pokazalo se da interakcija peptida s lipidnom membranom vodi povećanju propusnosti membrane, a time i uništenju bakterije. Za peptide sa amfipatskom α -uzvojnicom postoji više modela koji objašnjavaju način na koji djeluju: model bačvaste pore u kojem amfipatska α -uzvojnica stvara okomite pore kroz membranu, ili se stvaraju toroidalne pore. I Shai, Hung i Matsazuki model u kojem α -AMPi prekrivaju membranu ( zato se ovaj model često zove „carpeting“ model ), razaraju veze među lipidim u njoj, i na taj način je uništavaju. Također, istražuje se i kako fizikalna svojstva peptida utječu na njihovu aktivnost. Ustanovljeno je da ne postoji izravna korelacija između njihove aktivnosti i molekularne mase peptida, duljine peptida, te izoelektrične točke. S druge strane, pokazalo se da prisustvo pozitivno nabijenih aminokiselina ( kao što su lizin i arginin ) utječe na vezivanje peptida na membranu, te da veći broj pozitivno nabijenih aminokiselina može značiti i veću antimikrobnu aktivnost, ali ne nužno jer postoje i drugi faktori poput hidrofobnosti i amfipatičnosti. Da bi pokazala da je hidrofobnost uistinu povezana s terapeutskim indeksom, numerički sam odredila srednje hidrofobnosti 73 antimikrobna peptida dobivena iz žaba iz porodice Ranidea. Uspoređujući terapeutske indekse peptida i odgovarajuće srednje hidrofobnosti, pokazalo se da uistinu postoji veza između ove dvije veličine, te da peptidima s visokim terapeutskim indeksom odgovara vrijednosti srednje hidrofobnosti iz intervala -1.8 – -0.3. Trenutno se traži formula koja bi povezala sve parametre koji utječu na terapeutski indeks peptida u jednu veličinu koja bi učinkovito razdvajala peptide toksine od antibiotika i predviđala učinak peptida na ljudske stanice ( i bakterije ) na osnovi njihove primarne strukture.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Fizika, Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA