Pregled bibliografske jedinice broj: 542759
Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija
Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija, 2011., diplomski rad, preddiplomski, Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb
CROSBI ID: 542759 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Implementacija algoritma za računanje proteinskih interakcija
(Implementation of algorithm for computing protein interactions)
Autori
Kušević, Katarina
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski
Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Mjesto
Zagreb
Datum
29.06
Godina
2011
Stranica
30
Mentor
Šikić, Mile
Ključne riječi
proteini; elektrostatska sila; energija solvatacije; ASA; aminokiseline
(proteins; electrostatic energy; solvents energy; ASA; amino acids)
Sažetak
Algoritam implementiran ovim radom računa elektrostatsku silu između dvije aminokiseline i energiju solvatacije za pojedinu aminokiselinu. Elektrostatska sila računa se kao zbroj elektrostatskih sila pri međusobnim interakcijama svih atoma određene dvije aminokiseline. Podaci potrebni za računanje dobivaju se učitavanjem PDB datoteka i učitavanjem naboja svakog atoma u određenoj aminokiselini. Za izračun energije solvatacije svi potrebni podaci učitavaju se iz datoteke s vrijednostima površina dostupnih otapalu i potencijalom otapala svake aminokiseline.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Računarstvo
POVEZANOST RADA
Projekti:
036-0362214-1987 - Modeliranje kompleksnih sustava (Jeren, Branko, MZO ) ( CroRIS)
098-1191344-2860 - Proučavanje biomakromolekula računalnim metodama i razvoj novih algoritama (Tomić, Sanja, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb,
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb
Profili:
Mile Šikić
(mentor)
