Naslov
Primarna struktura viroidnih RNA i njihov patogeni učinak na agrume u Hrvatskoj
(Primary structure of viroid RNAs and their pathogenicity in Croatian citrus cultivars)

Autori
Škorić, Dijana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
14.04

Godina
2000

Stranica
113

Mentor
Krajačić, Mladen

Ključne riječi
viroidi; RNA; agrumi; sPAGE; RT-PCR; primarna struktura; patogeni potencijal
(viroids; RNA; citrus; sPAGE; RT-PCR; nucleotide sequence; pathogenic effects)

Sažetak
Biološkim pokusima i molekularno-biološkim metodama (sPAGE, RT-PCR) dokazana je prisutnost viroidnih RNA u 7 od 10 različitih uzoraka hrvatskih agruma. Određen je sastav viroidnog kompleksa u svakom pozitivnom uzorku. Svakoj viroidnoj varijanti iz kompleksa određena su biološka svojstva selektivnom amplifikacijom na ograničenom krugu domaćinskih biljaka, te primarna i sekundarna struktura. Svi uzorci limuna bili su zaraženi “egzokortis”-viroidom koji je u njima uvijek dolazio u kompleksu s viroidima CVd-II i CVd-III. Viroid CVd-IIa jedini je pronađen kao samostalan patogen i to u uzorku naranče, a u jednom uzorku mandarinke pronađen je viroidni kompleks koji je sadržavao samo viroide CVd-IIb i CVd-III. Pronađene varijante “egzokortis”-viroida su visokog patogenog potencijala i primarne strukture nalik tipičnim varijantama tog viroida izoliranima iz agruma, s jednom jedinstvenom promjenom u nukleotidnom sastavu (nt 129). Varijante CVd-IIa otkrivene u našim agrumima tipične su primarne strukture, vrlo slabog patogenog potencijala i stoga bi bila moguća njihova primjena u unapređenju agrumarstva u nas. Nađene varijante CVd-IIb strukturno su najsličnije varijanti Ca-302 – uzročniku bolesti “cachexia” vrlo slabe patogenosti. Pronađena je jedna varijanta CVd-II slabe patogenosti koja je po strukturi na razmeđi između tipičnog viroida CVd-IIb i Ca-302. Gotovo sve varijante viroida CVd-III iz naših uzoraka su identične tipičnoj i najrasprostranjenijoj varijanti CVd-IIIb niskog patogenog potencijala. Međutim, otkrivena je i varijanta CVd-III duga 294 nt, slabe patogenosti i jedinstvenih strukturnih svojstava. Vjerojatno se radi o novoj varijanti viroida CVd-III.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA