Naslov
Genotipizacija krčke i dubrovačke pasmine ovaca
(Genotyping of Krk island sheep and the Ruda sheep of Dubrovnik)

Autori
Bradić, Martina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, magistarski rad

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
21.07

Godina
2005

Stranica
88

Mentor
Mioč, Boro

Neposredni voditelj
Mioč, Boro

Ključne riječi
mikrosatelitni lokus; alelna varijanta; mtDNA; haplotip; krčka ovca; dubrovačka ovca; genetička struktura
(microsatellite locus; allelic variants; mtDNA; haplotype; krk island sheep; ruda sheep of dubrovnik; genetic structure)

Sažetak
SAŽETAK Kako bi se utvrdio nastanak i razvoj populacija krčke i dubrovačke ovce u Republici Hrvatskoj tipizirani su lokusi nukleusne i mitohondrijske DNA. Ocijenjene su alelne varijante, stupanj heterozigotnosti, te genetske udaljenosti među navedenima kao i njima srodnim populacijama. Tipizirano je 10 mikrosatelitnih lokusa na 31 jedinki krčke i 44 jedinke dubrovačke ovce. Prosječna vrijednost alela po mikrosatelitnom lokusu iznosila je 4, 90 za krčku populaciju, a 4, 60 za dubrovačku populaciju. Utvrđene su i srednje vrijednosti očekivane heterozigotnosti He (K = 0, 6760, D = 0, 6575). Genetička struktura populacije istraživana je analizom varijance programskim paketom WinAMOVA 1.55. Rezultati su pokazali da 19 % ukupne varijabilnosti otpada na razlike između populacija, a veći dio otpada na međusobnu razliku između jedinki (81 %) uz P < 0, 0010 i da &#952; st iznosi 0, 190, što dokazuje signifikantno postojanje dviju skupina istraživanih jedinki, kako se i pretpostavljalo. Za izračunavanje matrice genetske sličnosti i konstrukciju Neighbour-Joining filogenetskog stabla korišten je programski paket Phylip. Filogenetsko stablo pokazuje dva jasno odvojena klastera koji predstavljaju dvije populacije. Sekvenciran je 482 bp dug fragment dijela D-loop regije (nt 15446-15934) dubrovačke i krčke ovce. U analizu je uključeno 20 sekvenci. Pronađena su 23 polimorfna mjesta, a prosječna haplotipna različitost unutar 20 istraživanih sekvenci iznosi Hd = 0, 9842. Analiza različitosti sekvenci između haplotipova hrvatskih pasmina ovaca, korištenjem MP i N - J metoda pokazala je sličnu topologiju filogenetskih stabala. Pronađeno je mnogo malih klastera, no samo jedan klaster je genetički različit i jasno odvojen. Taj klaster se sastoji od 14 haplotipova (17 sekvenci) i sličan je europskom tipu mtDNA merinolandschaf sekvence poznatom u gen banci (AccNo. AF010406) pod nazivom haplotip B. Preostale tri sekvence (K11, K12, K19) nisu definirale haplogrupu. Unutar postojećeg klastera identičnost s europskim tipom sekvence kretala se od 99 % do 99, 4 %, dok je identičnost europskog tipa sekvence s ostalim trima sekvencama bila od 96, 07 % do 96, 3 %. Na osnovi ispitivanih sekvenci može se zaključiti da su na stvaranje ovih pasmina utjecala dva glavna genetička izvora. Molekularni podaci u ovom istraživanju potvrđuju zapise o merinizaciji autohtonih pasmina s istraživanih područja. Što se tiče ostalih triju sekvenci može se također pretpostaviti da njihov haplotip vjerojatno pripada originalnoj otočkoj pramenki. Ključne riječi: mikrosatelitni lokus, alelna varijanta, mtDNA, haplotip, krčka ovca, dubrovačka ovca, genetička struktura

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA