Naslov
Struktura kationiranih aminokiselina i njihovih metilnih estera u plinskoj fazi
(Gas phase structure of cationized amino acids and their methyl esters)

Autori
Rožman, Marko

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
23.03

Godina
2005

Stranica
98

Mentor
Srzić, Dunja

Ključne riječi
aminokiseline / H/D izmjena / reakcijski mehanizam / spektrometrija masa / teorija funkcionala gustoće
(amino acids / density functional theory / H/D exchange / reaction mechanism / mass spectrometry)

Sažetak
Koristeći H/D izmjenu, teoriju funkcionala gustoće te molekulsku dinamiku proučavane su strukture kationiranih aminokiselina i njihovih metilnih estera u plinskoj fazi. Utvrđeno je da početni eksperimentalni uvjeti u spektrometru masa ne utječu na konformaciju promatrane molekule. Kako bi se jednoznačno interpretirali eksperimentalni rezultati objašnjena je interakcija protonirane aminokiseline s donorom deuterija, struktura reakcijskog kompleksa te reakcijski mehanizam izotopne izmjene. U skladu s tim rezultatima pokazano je da u protoniranim aminokiselinama postoji više mjesta za stabilizaciju donora deuterija, što rezultira kompetitivnom izotopnom izmjenom. Dobiveni eksperimentalni podatci potvrđuju predloženi reakcijski mehanizam te ukazuju na niz strukturnih zaključaka. Sukladno već provedenim studijama potvrđeno je da aminokiselina koja sadrži bočnu funkcionalnu skupinu veže kation natrija u strukturu solvatiranog naboja. Utvrđeno je da eksperimenti kinetičke metode za molekulu Na+ kationiranog izoleucina ne odražavaju stvarno stanje populacije konformera u plinskoj fazi. Razlike između strukturnih zaključaka o konformacijama natrijem kationiranih aminokiselina, dobivenih na temelju eksperimentalnih i teorijskih rezultata, objašnjene su kao posljedica perturbacije najpovoljnije forme promatrane aminokiseline od strane donora deuterija. Reakcijski mehanizam H/D izmjene na Na+ kationiranim aminokiselinama pokazuje da reakciji H/D izmjene prethodi energijski slobodna perturbacija aminokiseline iz CS u ZW formu koja je katalizirana molekulom D2O.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA