Naslov
Analiza staničnog ekosustava tkiva štitnjače sekvenciranjem jednostanične RNK
(The thyroid cell ecosystem analyzed by single-cell RNA sequencing)

Autori
Ilić, Klara

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Medicinski fakultet Osijek

Mjesto
Osijek

Datum
28.09

Godina
2022

Stranica
43

Mentor
Štefanić, Mario

Ključne riječi
sekvenciranje jednostanične RNK ; štitnjača ; atlas ; bioinformatika
(Single-Cell RNA-Seq ; Thyroid Gland ; Atlas ; Bioinformatics)

Sažetak
CILJ ISTRAŽIVANJA. Unatoč važnosti hormona štitnjače u sustavnoj homeostazi, humano tkivo štitnjače još uvijek nije potpuno opisano. METODE. U tu svrhu, integrirani su i analizirani javno dostupni podatci sekvenciranja jednostanične RNK pet štitnih žlijezda odraslih osoba (Gene Expression Omnibus Identifier GSE134355, GSE158291, Seurat v4 alat), što je omogućilo raščlambu staničnog susjedstva štitnjače na srednjoj rezoluciji. Uključene su samo stanice benignog tkiva štitnjače. Nakon diferencijalne analize genskog izražaja (Wilcoxonov test) uslijedila je analiza obogaćenih putova (Hallmark, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, Broad Molecular Signatures Database v7.4). REZULTATI. Ukupno je analizirano > 18 000 stanica visoke kvalitete te je identificirano 28 staničnih stanja (7 epitelnih, 9 limfoidnih, 6 mijeloidnih, 3 stromalna, 2 endotelna i jedan proliferativni klaster). Okarakterizirani su genski izražaji specifični za stanične tipove i biološki programi za sve veće stanične linije štitnjače koji pružaju informacije o njihovim transkripcijskim, signalizacijskim i metaboličkim svojstvima. ZAKLJUČAK. Sveobuhvatni jednostanični atlas humane štitne žlijezde je vrijedan resurs koji povećava naše razumijevanje o staničnoj heterogenosti i mikrookolišima specifičnih tkiva.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Temeljne medicinske znanosti

POVEZANOST RADA