Pregled bibliografske jedinice broj: 1262842
Raznolikost tipova vegetativne kompatibilnosti gljive Cryphonectria parasitica i genska analiza ORFA regije virusa Cryphonectria hypovirus 1 u tri populacije kontinentalne Hrvatske
Raznolikost tipova vegetativne kompatibilnosti gljive Cryphonectria parasitica i genska analiza ORFA regije virusa Cryphonectria hypovirus 1 u tri populacije kontinentalne Hrvatske, 2022., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek, Zagreb
CROSBI ID: 1262842 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Raznolikost tipova vegetativne kompatibilnosti
gljive Cryphonectria parasitica i genska analiza
ORFA regije virusa Cryphonectria hypovirus 1 u tri
populacije kontinentalne Hrvatske
(Vegetative compatibility type diversity of
Cryphonectria parasitica and genetic analysis of
Cryphonectria hypovirus 1 ORFA region from three
continental Croatian populations)
Autori
Škegro, Ivan
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet, Biološki odsjek
Mjesto
Zagreb
Datum
19.12
Godina
2022
Stranica
69
Mentor
Ježić, Marin
Ključne riječi
rak kore kestena, RNA virus, molekularna filogenija
(chestnut blight, RNA virus, molecular phylogeny)
Sažetak
Gljiva mješinarka Cryphonectria parasitica uzročnik je bolesti raka kore pitomog kestena (Castanea sativa), a infekcija te gljive virusom Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) joj smanjuje virulenciju, te tako omogućava prirodnu biološku kontrolu spomenute bolesti. Virus CHV1 je najbolje proučena vrsta hipovirusa i jedina prisutna u Europi, gdje postoji njegovih pet podtipova. Horizontalni prijenos virusa CHV1 ograničen je sustavom vegetativne (ne)kompatibilnosti gljive C. parasitica, tzv. vc-tipom gljive. U tri proučavane populacije kontinentalne Hrvatske utvrđeno je 12 različitih vc-tipova, među 54 izolata gljive C. parasitica. U populaciji Hrvatske Kostajnice najzastupljeniji vc-tipovi su EU-1 (22%), te EU-2 i EU-26 (17%), u populaciji Požege to su vc-tipovi EU-2 (58%) i EU-1 (19%), te konačno u populaciji Slunja to je vc-tip EU-2 (40%). Prisutnost hipovirusa dokazana je izolacijom ukupne RNA, reverznom transkripcijom, te amplifikacijom dijela genomske regije ORFA. Prevalencija virusa CHV1 na području Hrvatske Kostajnice iznosi 61%, a u Požegi 23%. Nakon sekvenciranja umnoženih fragmenata potvrđeno je da izolati virusa CHV1 pripadaju talijanskom podtipu, te su najsrodniji izolatima iz Slovenije, Italije i Švicarske.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IZHRZ0_180651 - Dynamics of virus infection in mycovirus-mediated biological control of a fungal pathogen (DynaMyco) (Ježić, Marin, HRZZ - Croatian-Swiss Research Programme 2017 - 2023) ( CroRIS)
Profili:
Marin Ježić
(mentor)