Naslov
Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
(Mechanisms regulating the CRISPR-Cas system in Echerichia coli)

Autori
Damjan Mitić

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27.01

Godina
2023

Stranica
106

Mentor
Ivančić Baće, Ivana

Ključne riječi
E. coli, CRISPR-Cas, Cas3, StpA, HtpG, Lon

Sažetak
Sustav CRISPR-Cas je adaptivni imunosni sustav za obranu prokariota od stranih genetičkih elemenata. Regulacija sustava CRISPR-Cas u bakteriji E. coli je kompleksna i nije u potpunosti razjašnjena. Poznato je da protein H-NS djeluje na razini transkripcije, šaperon HtpG na razini post-translacije, dok temperatura utječe na aktivnost proteina Cas3 na nepoznati način. U ovom radu su detaljnije istraženi mehanizmi regulacije aktivnosti sustava CRISPR-Cas na razini transkripcije i post-translacije. Praćenjem otpornosti stanica na infekciju fagom λvir i određivanjem količine transkripata gena cas utvrđeno je da protein StpA može inhibirati promotore Pcas8e i anti-Pcas u nedostatku proteina H-NS, te da pojačana ekspresija ili inaktivacija proteaze Lon u mutantu hns aktivira zaštitu od infekcije neovisno o sustavu CRISPR-Cas. Na aktivnost proteina Cas3 utječe ''anti-sense'' mRNA na nepoznat način, dok temperatura uzrokuje alosteričku promjenu konformacije kojom se inhibira nukleazna aktivnost. Šaperon HtpG nije utjecao na količine proteina Cas3, već vjerojatno zauzimanje njegove pravilne konformacije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA