Pretraga

Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1244987

Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima

Turudić, Ante; Liber, Zlatko; Grdiša, Martina; Jakše, Jernej; Varga, Filip; Šatović, Zlatko
Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima // Zbornik sažetaka 15. međunarodnog kongresa oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo / Dugalić, Ivana ; Haramija, Josip (ur.).
Zagreb: Hrvatsko agronomsko društvo, 2022. str. 33-34 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)

CROSBI ID: 1244987 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima
(Detection of divergences in chloroplast genomic data)

Autori
Turudić, Ante ; Liber, Zlatko ; Grdiša, Martina ; Jakše, Jernej ; Varga, Filip ; Šatović, Zlatko

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Zbornik sažetaka 15. međunarodnog kongresa oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo / Dugalić, Ivana ; Haramija, Josip - Zagreb : Hrvatsko agronomsko društvo, 2022, 33-34

Skup
15. međunarodni kongres Oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo

Mjesto i datum
Zadar, Hrvatska, 08.11.2022. - 11.11.2022

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija

Ključne riječi
javni genetski podaci ; kloroplastni genom ; proces sastavljanja genoma ; provjera podataka
(public genomic data ; chloroplast genome ; assembling process ; data checking)

Sažetak
Kloroplastni genomi su važan tip podataka u biljnim genomskim istraživanjima jer se često koriste u filogenetskim istraživanjima. Napredak tehnologija sekvenciranja i metoda sastavljanja sekvenci genoma pridonosi povećanju broja javno dostupnih sekvenci kloroplastnog genoma. Broj sastavljenih cjelokupnih kloroplastnih sekvenci je barem za red veličine veći od sastavljenih jezgrenih DNA sekvenci. Stabilna genetska struktura i uniparentalno nasljeđivanje kloroplasta dovodi do niske stope mutacija tijekom evolucije, pa bi tako srodne vrste morale imati vrlo slične kloroplastne sekvence. Ova činjenica te dostupnost velike količine podataka cjelokupnih kloroplastnih genoma omogućila je analizu metoda identifikacije mogućih odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima. Identifikacija odstupanja ukazuje na moguće greške prilikom sastavljanja sekvenci. Analizirali smo odstupanja između sekvenci koje bi trebale biti vrlo slične i provjerili jesu li ta odstupanja uzrokovana različitim metodama sastavljanja sekvenci. Dobiveni rezultati ukazuju na postojanje odstupanja u proučavanim kompletnim kloroplastnim sekvencama te potrebu dodatnih provjera postojećih javno dostupnih podataka.Stoga je moguće unaprijediti i postojeće metode sastavljanja sekvenci uključivanjem sličnih provjera.

Izvorni jezik
Hrvatski, engleski

Znanstvena područja
Biologija, Poljoprivreda (agronomija)



POVEZANOST RADA

Projekti:
--KK.01.1.1.01.0005 - Znanstveni centar izvrsnosti za bioraznolikost i molekularno oplemenjivanje bilja (ZCI CroP-BioDiv) (Šatović, Zlatko; Liber, Zlatko) ( CroRIS)

Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb,
Agronomski fakultet, Zagreb

Profili:

Avatar Url Martina Grdiša (autor)

Avatar Url Ante Turudić (autor)

Avatar Url Filip Varga (autor)

Avatar Url Zlatko Šatović (autor)

Avatar Url Zlatko Liber (autor)

Citiraj ovu publikaciju:

Turudić, Ante; Liber, Zlatko; Grdiša, Martina; Jakše, Jernej; Varga, Filip; Šatović, Zlatko
Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima // Zbornik sažetaka 15. međunarodnog kongresa oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo / Dugalić, Ivana ; Haramija, Josip (ur.).
Zagreb: Hrvatsko agronomsko društvo, 2022. str. 33-34 (predavanje, međunarodna recenzija, sažetak, znanstveni)
Turudić, A., Liber, Z., Grdiša, M., Jakše, J., Varga, F. & Šatović, Z. (2022) Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima. U: Dugalić, I. & Haramija, J. (ur.)Zbornik sažetaka 15. međunarodnog kongresa oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo.
@article{article, author = {Turudi\'{c}, Ante and Liber, Zlatko and Grdi\v{s}a, Martina and Jak\v{s}e, Jernej and Varga, Filip and \v{S}atovi\'{c}, Zlatko}, year = {2022}, pages = {33-34}, keywords = {javni genetski podaci, kloroplastni genom, proces sastavljanja genoma, provjera podataka}, title = {Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima}, keyword = {javni genetski podaci, kloroplastni genom, proces sastavljanja genoma, provjera podataka}, publisher = {Hrvatsko agronomsko dru\v{s}tvo}, publisherplace = {Zadar, Hrvatska} }
@article{article, author = {Turudi\'{c}, Ante and Liber, Zlatko and Grdi\v{s}a, Martina and Jak\v{s}e, Jernej and Varga, Filip and \v{S}atovi\'{c}, Zlatko}, year = {2022}, pages = {33-34}, keywords = {public genomic data, chloroplast genome, assembling process, data checking}, title = {Detection of divergences in chloroplast genomic data}, keyword = {public genomic data, chloroplast genome, assembling process, data checking}, publisher = {Hrvatsko agronomsko dru\v{s}tvo}, publisherplace = {Zadar, Hrvatska} }

Podijeli:





Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font
CROSBI koristi kolačiće (cookies) kako bi poboljšao funkcionalnost stranice.