Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1223277

Detekcija i djelomična molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze


Nikolić, Kristina
Detekcija i djelomična molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze, 2021., diplomski rad, diplomski, Agronomski fakultet, Zagreb


CROSBI ID: 1223277 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Detekcija i djelomična molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze
(Detection and Partial Molecular Characterization of Grapevine Virus H from Autochthonous Grapevine Varieties)

Autori
Nikolić, Kristina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
27.09

Godina
2021

Stranica
41

Mentor
Vončina, Darko

Neposredni voditelj
Jagunić, Martin

Ključne riječi
vinova loza, H-virus vinove loze, GVH, PCR, sekvenciranje
(grapevine, grapevine virus H, GVH, PCR, sequencing)

Sažetak
Vinova loza (Vitis vinifera L.) poznata je kao kultura s najvećim brojem poznatih viroza, a samo manji broj virusa ima ekonomsku važnost te se oni povezuju s najvažnijim skupinama bolesti vinove loze, a jedna od njih je i naboranost drveta vinove loze. Kompleks naboranosti drveta vinove loze povezan je s vrstama roda Vitivirus u koje se ubraja i H-virus vinove loze (grapevine virus H, GVH). Istraživanje u kojem je testirano 113 trsova vinove loze, provedeno je na autohtonim sortama iz kolekcijskog nasada smještenog na vinogradarsko- vinarskom pokušalištu Jazbina. Detekcija virusa provedena je uporabom PCR metode u stvarnom vremenu te je potvrđena konvencionalnom RT-PCR metodom čiji su produkti vizualizirani nakon provedbe horizontalne gel elektroforeze. U ovom radu eksperimentalno je po prvi puta u Hrvatskoj dokazana prisutnost GVH u postotku zaraze od ~8% na sortama Gustopupica, Malvazija istarska, Muškatel, Babica plosnata, Brajdica bijela, Plavčina, Bljuzgavac, Svrdlovina crna i Kozak. Izolati su sekvencirani u oba smjera i to u dva područja genoma (RNA ovisna RNA polimeraza (RdRp) i protein omotača (CP)) te je njihova međusobna usporedba, kao i usporedba sa stranim izolatima, pokazala razlikovanja na nukleotidnoj i aminokiselinskoj razini. Unutar sekvenci hrvatskih izolata RdRp područja pronađena je sličnost između 95.5 do 99.15% na nukleotidnoj te 95.76 do 100% na aminokiselinskoj razini, dok je unutar CP područja sličnost varirala od 97.47 do 99.43% na nt i od 98.3 do 100% na ak razini. Filogenetskom analizom utvrđeno je grupiranje izolata prema geografskom podrijetlu samo kod sekvenci RdRp područja genoma.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Poljoprivreda (agronomija), Interdisciplinarne biotehničke znanosti



POVEZANOST RADA


Projekti:
IP-2018-01-1305 - Ekologija i karakterizacija dva nova virusa vinove loze (ENVISaGE) (Voncina, Darko, HRZZ - 2018-01) ( CroRIS)
EK-EFRR-KK.01.1.1.04.0031 - Novi početak za stare hrvatske sorte vinove loze (CroVitiRestart) (Preiner, Darko; Ašperger, Danijela; Kovačević-Ganić, Karin, EK - KK.01.1.1.04) ( CroRIS)

Profili:

Avatar Url Martin Jagunić (mentor)

Avatar Url Darko Vončina (mentor)


Citiraj ovu publikaciju:

Nikolić, Kristina
Detekcija i djelomična molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze, 2021., diplomski rad, diplomski, Agronomski fakultet, Zagreb
Nikolić, K. (2021) 'Detekcija i djelomična molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze', diplomski rad, diplomski, Agronomski fakultet, Zagreb.
@phdthesis{phdthesis, author = {Nikoli\'{c}, Kristina}, year = {2021}, pages = {41}, keywords = {vinova loza, H-virus vinove loze, GVH, PCR, sekvenciranje}, title = {Detekcija i djelomi\v{c}na molekularna karakterizacija H-virusa vinove loze iz autohtonih sorata vinove loze}, keyword = {vinova loza, H-virus vinove loze, GVH, PCR, sekvenciranje}, publisherplace = {Zagreb} }
@phdthesis{phdthesis, author = {Nikoli\'{c}, Kristina}, year = {2021}, pages = {41}, keywords = {grapevine, grapevine virus H, GVH, PCR, sequencing}, title = {Detection and Partial Molecular Characterization of Grapevine Virus H from Autochthonous Grapevine Varieties}, keyword = {grapevine, grapevine virus H, GVH, PCR, sequencing}, publisherplace = {Zagreb} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font