Pregled bibliografske jedinice broj: 1206454
MODELIRANJE PROTEN-DNA KOMPLEKSA TRANSKRIPCIJSKOG FAKTORA MntR IZ BAKTERIJE Bacillus subtilis
MODELIRANJE PROTEN-DNA KOMPLEKSA TRANSKRIPCIJSKOG FAKTORA MntR IZ BAKTERIJE Bacillus subtilis // 6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a - KNJIGA SAŽETAKA / Schneider, Petra (ur.).
Zagreb, 2022. str. 262-262 (poster, nije recenziran, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 1206454 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
MODELIRANJE PROTEN-DNA KOMPLEKSA TRANSKRIPCIJSKOG
FAKTORA MntR IZ BAKTERIJE Bacillus subtilis
(MODELLING THE PROTEIN-DNA COMPLEX BETWEEN THE
TRANSCRIPTION FACTOR MntR FROM Bacillus subtilis
AND ITS TARGET DNA SEQUENCE)
Autori
Jelic Matošević, Zoe ; Bertoša, Branimir
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a - KNJIGA SAŽETAKA
/ Schneider, Petra - Zagreb, 2022, 262-262
ISBN
978-953-6076-93-2
Skup
6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a = 6th Faculty of Science PhD Student Symposium
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 23.04.2022. - 24.04.2022
Vrsta sudjelovanja
Poster
Vrsta recenzije
Nije recenziran
Ključne riječi
molekulska dinamika, transkripcijski faktori, MntR
(molecular dynamics, transcription factors, MntR)
Sažetak
Porodica bakterijskih transkripcijskih faktora MntR sudjeluje u regulaciji homeostaze metalnih iona u velikom broju bakterijskih vrsta. Transkripcijski faktor MntR iz bakterije Bacillus subtilis je manganov metalosenzor koji veže manganove ione u binuklearna vezna mjesta kada stanična koncentracija manganovih iona prijeđe optimalnu vrijednost, što ga aktivira za vezanje na DNA i represiju ekspresije gena za unos manganovih iona [1]. Iako je ovaj protein dobro istražen [2, 3], niti u literaturi, niti u dostupnim bazama podataka ne postoje strukture ovog proteina u kompleksu s ciljnom DNA sekvencom. U svrhu podrobnijeg istraživanja proteina MntR, provedene su simulacije molekulske dinamike proteina u kompleksu s DNA te same ciljane DNA sekvence. Na temelju klaster analize dobivenih trajektorija izabrane su strukture za izgradnju protein-DNA kompleksa homolognim modeliranjem na temelju protein-DNA strukture DtxR proteina iz MntR proteinske obitelji.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IP-2020-02-3446 - Manganovi metalosenzori (MaMes) (Bertoša, Branimir, HRZZ - 2020-02) ( CroRIS)
HRZZ-IP-2020-02-3446 - Manganovi metalosenzori (MaMes) (Bertoša, Branimir, HRZZ - 2020-02) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb