Pregled bibliografske jedinice broj: 1206131
Računalne simulacije proteina SloR iz bakterije Streptococcus mutans
Računalne simulacije proteina SloR iz bakterije Streptococcus mutans // 6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a 2021 : knjiga sažetaka / Schneider, Petra (ur.).
Zagreb, 2022. str. 294-295 (poster, nije recenziran, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 1206131 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Računalne simulacije proteina SloR iz bakterije Streptococcus mutans
(Computational simulations of the SloR metalloregulatory protein from the bacterium Streptococcus mutans)
Autori
Radman, Katarina ; Bertoša, Branimir
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a 2021 : knjiga sažetaka
/ Schneider, Petra - Zagreb, 2022, 294-295
Skup
6. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a = 6th Faculty of Science PhD Student Symposium
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 23.04.2022. - 24.04.2022
Vrsta sudjelovanja
Poster
Vrsta recenzije
Nije recenziran
Ključne riječi
poster, simulacije molekularne dinamike, S. mutans, SloR
(poster, molecular dynamics simulations, S.mutans, SloR)
Sažetak
Streptococcus mutans, primarni uzročnik dentalnog karijesa kod ljudi, je patogena bakterija koja raste na površini zuba i sastavni je dio dentalnog plaka. Homeostaza iona metala od esencijalne je važnosti za rast i preživljavanje većine mikroorganizama, uključujući bakteriju S. mutans [1]. Dvovalentni ioni metala, kao što su Fe2+ i Mn2+, nužni su kofaktori easencijalnih enzima te često aktiviraju i stabiliziraju strukture proteina u raznim metaboličkim putevima. Homeostaza iona Fe2+ i Mn2+ u bakteriji S. mutans regulirana je od strane proteina SloR. SloR je transkripcijski faktor kojem afinitet vezanja za molekulu DNA ovisi o koncentraciji iona mangana [2]. U fiziološkim uvjetima, protein SloR se nalazi u obliku homodimera kod kojeg svaka podjedinica veže tri iona mangana [3]. Provedene su simulacije molekulske dinamike kojima se nastoje istražiti strukturna i dinamička svojstva različitih oblika proteina SloR uz korištenje različitih parametara za opis interakcija manganovih iona i aminokiselina.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija, Biologija, Računarstvo
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IP-2020-02-3446 - Manganovi metalosenzori (MaMes) (Bertoša, Branimir, HRZZ - 2020-02) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb