Naslov
Raspodijeljeno de novo sastavljanje genoma na platformi Apache Spark
(Distributed De Novo Genome Assembly on Apache Spark)

Autori
Džaja, Mirko

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
09.07

Godina
2021

Stranica
30

Mentor
Pripužić, Krešimir

Ključne riječi
de novo ; genom ; Apache Spark ; grozd ; SORA ; SpaRC
(de novo ; genome ; Apache Spark ; cluster ; SORA ; SpaRC)

Sažetak
U ovom radu je predstavljeno sastavljanje genoma na raspodijeljenim sustavima. Konkretno, detaljno je opisana platforma Apache Spark koja omogućuje raspodijeljeno izvođenje. Predstavljeno je sastavljanje genoma, dvije tehnike od kojih smo se odlučili za de novo da je pobliže opišemo. Uspoređujući dva de novo algoritma, SORA i SpaRC, došli smo do zaključka da postoji široki spektar različitih algoritama koji imaju različite stupnjeve raspodijeljenosti. Zahvaljujući tome svatko može izabrati koji će algoritam koristiti u svojim istraživanjima, a to prvenstveno ovisi o dostupnim računalnim resursima.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo

POVEZANOST RADA