Naslov
Transkripcijske značajke pleomorfnih varijanti bakterije Borrelia burgdorferi
(Transcriptome profiling of Borrelia burgdorferi pleomorphic variants)

Autori
Čorak, Nina ; Daschkin, Christina ; Krey, Viktoria ; Koska, Sara ; Futo, Momir ; Široki, Tin ; Anniko, Sirli ; Woichansky, Innokenty ; Opašić, Luka ; Kifer, Domagoj ; Vlahoviček, Kristian ; Maxeiner, Horst-Günter ; Domazet-Lošo, Mirjana ; Nicolaus, Carsten ; Domazet-Lošo, Tomislav

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, ostalo

Skup
5. Simpozij Studenata Doktorskih Studija PMF-a

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 24.04.2021. - 25.04.2021

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Podatak o recenziji nije dostupan

Ključne riječi
transkriptom, pleomorfne varijante, Borrelia burgdorferi
(transcriptome, pleomorphic variants, Borrelia burgdorferi)

Sažetak
Bakterija Borrelia burgdorferi vektorski se prenosi putem krpelja i primarni je uzročnik Lajamske bolesti. U laboratorijskim uvjetima stanice B. burgdorferi mogu postojati u nekoliko različitih pleomorfnih oblika (morfotipova). Dok su funkcionalne i strukturne razlike među nekim morfotipovima već prethodno opisane, ekspresijske razlike na razini transkriptoma do sada nisu istražene. S tim ciljem uzgojili smo laboratorijske kulture različitih morfotipova (spiralni, okrugli, bleb i biofilm), izolirali ukupnu RNA, sekvencirali je te skupili podatke o razlici u ekspresiji na razini transkriptoma. Otkrili smo da unatoč morfološkim razlikama, spiralni i okrugli morfotipovi imaju sličan ekspresijski profil, dok bleb i biofilm morfotipovi pokazuju značajnu razliku u ekspresiji kako međusobno tako i u odnosu na spiralni i okrugli morfotip. Unatoč tome što okrugli morfotip ima transkripciju sličnu spiralnom morfotipu, u okruglom morfotipu su pojačano su eksprimirani geni uključeni u procese transkripcije i translacije. Iako bleb i biofilm morfotipovi imaju veći broj pojačano eksprimiranih gena o odnosu na okrugli oblik, funkcija tih gena je pretežito nepoznata. Geni koji su pojačano eksprimirani u okruglom morfotipu su pretežito locirani na bakterijskom kromosomu, dok se pojačano eksprimirani geni bleb i biofilm morfotipova uglavnom nalaze na plazmidima. Kako bi definirali evolucijsko podrijetlo diferencijalno eksprimiranih gena bakterije B. burgdorferi koristili smo genomsku filostratigrafiju. Otkrili smo da su geni koji su pojačano eksprimirani u okruglom morfotipu obogaćeni evolucijski starim genima karakterističnim za sve stanične organizme, dok su geni pojačano eksprimirani u bleb i biofilm morfotipovima evolucijski mlađi i specifični za porodicu Borreliaceae. Naši rezultati upućuju na to da je tranzicija iz spiralnog u okrugli morfotip regulirana malim brojem evolucijski visoko konzerviranih gena koji sudjeluju u transkripciji i translaciji, dok je prijelaz iz spiralnog morfotipa u bleb ili biofilm morfotip popraćen velikim ekspresijskim promjenama koje uključuju pojačanu ekspresiju evolucijski mlađih gena nepoznate funkcije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA