Naslov
Računalne simulacije transkripcijskog faktora MntR iz bakterije Bacillus subtilis
(Computational simulations of the transcriptional regulator MntR from the bacteriujm Bacillus subtilis)

Autori
Jelić Matošević, Zoe ; Loubser, Jolene ; Cukrowski, Ignacy ; Bertoša, Branimir

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
5. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a 2021 : knjiga sažetaka / Barišić, Dajana - Zagreb, 2021, 330-331

ISBN
978-953-6076-90-1

Skup
5. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a = 5th Faculty of Science PhD Student Symposium

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 24.04.2021. - 25.04.2021

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
molekulska dinamika, transkripcijski faktori, MntR
(electrostatics ; polarization ; interaction energy ; Hansen–Coppens model ; protein–ligand interactions ; Charger)

Sažetak
Homeostaza iona prijelaznih metala od esencijalne je važnosti za mikroorganizme. Naime, ioni prijelaznih metala nužni su za normalno funkcioniranje stanice, ali visoke koncentracije istih mogu biti toksične. Stoga su razvijeni osjetljivi mehanizmi kontrole i regulacije stanične koncentracije iona prijelaznih metala. Kod bakterija se homeostaza metala najčešće regulira metalosenzorima – transkripcijskim faktorima čiji afinitet za vezanje DNA ovisi o vezanju metalnih iona [1]. Bakterija Bacillus subtilis živi u tlu i kao crijevni komenzal te je modelni organizam za gram-pozitivne bakterije. U B. subtilis homeostaza mangana regulirana je transkripcijskim faktorom MntR, čiji se afinitet za DNA povećava uslijed vezanja manganovih iona [2]. MntR se u otopini nalazi kao dimer, a svaka podjedinica veže dva iona mangana u binuklearnom veznom mjestu [3, 4]. Simulacijama molekulske dinamike istraženi su alosterički efekti koje izaziva vezanje Mn2+ iona u vezna mjesta MntR proteina.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA