Naslov
Biokemijska karakterizacija adenilosukcinat- sintetaze bakterije Helicobacter pylori eksperimentalnim i računalnim metodama
(Biochemical characterization of adenylosuccinate synthetase from Helicobacter pylori using experimental and computational methods)

Autori
Bubić, Ante

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
21.09

Godina
2021

Stranica
95

Mentor
Bertoša, Branimir ; Leščić Ašler, Ivana

Ključne riječi
adenilosukcinat-sintetaza ; enzimska kinetika ; Helicobacter pylori ; histidinski privjesak ; kristalna struktura ; molekularna dinamika
(adenylosuccinate synthetase ; crystal structure ; enzyme kinetics ; Helicobacter pylori ; histidine tag ; molecular dynamics)

Sažetak
Adenilosukcinat-sintetaza (AdSS) je esencijalan enzim u biosintezi purina, i de novo, i reciklirajućim putem. U ovoj disertaciji je računalno i eksperimentalno karakterizirana AdSS iz bakterije Helicobacter pylori koja pripada skupini I kancerogena. Pročišćen je enzim sa i bez histidinskog privjeska na C-kraju. Za oba enzima su određeni specifična aktivnost, temperaturno i pH područje stabilnosti, te kinetički parametri prema supstratima i inhibitorima. Dobiveni rezultati ukazuju na to da dodani histidinski privjesak nema značajan utjecaj na funkciju enzima. Riješena kristalna struktura AdSS pri visokoj rezoluciji, korištena za karakterizaciju enzima računalnim metodama, otkriva stvaranje stabilnog međuprodukta 6'-fosforil-IMP u aktivnom mjestu enzima. Računalnim metodama identificirane su ključne interakcije za stabilizaciju supstrata u aktivnom mjestu. Analiza kristalne strukture i računalna karakterizacija interakcija proteina s ligandima ukazuju na veliku sličnost AdSS iz bakterije H. pylori s AdSS iz vrste Escherichia coli, stoga se može pretpostaviti i sličan mehanizam rada enzima.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA