Naslov
Uloga proteomike u utvrđivanju proteina uključenih u patofiziologiju oboljenja jetre
(The role of proteomics in determining the proteins involved in the pathophysiology of liver disease)

Autori
Antonela Lacković

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Odjel za biotehnologiju

Mjesto
Rijeka

Datum
07.09

Godina
2021

Stranica
48

Mentor
Jasminka Giacometti

Ključne riječi
proteomička analiza ; jetra ; hepatotoksičnost ; sustav klasifikacije proteina PANTHER, STRING baza
(proteomic analysis, liver, hepatotoxicity, PANTHER classification protein system, STRING database)

Sažetak
Kronična bolest jetre predstavlja veliki i rastući zdravstveni i ekonomski teret u društvu. Bolesti jetre su općenito asimptomatske sve dok ne dođe do očitih komplikacija i do ozbiljnog oštećenja jetre. S obzirom na progresivni i općenito neotkriveni tijek bolesti jetre, od velike važnosti je primjena modernih „omics“ tehnologija u identifikaciji specifičnih proteina koji bi mogli imati uzročnu ulogu u bolesti. Povezivanjem genetskih čimbenika s bolestima putem specifičnih proteina, omogućava se isticanje potencijalnih terapijskih ciljeva, usklađivanje postojećih lijekova s novim indikacijama bolesti i smanjuje potencijalna sumnja u sigurnost lijekova u razvoju. Razvrstavanje specifičnih proteina bitno je u obradi rezultata proteomičke analize. U ovom radu korišten je sustav klasifikacije PANTHER i baza STRING za predviđanje interakcija proteina. Sustav klasifikacije PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships) je dizajniran je za klasifikaciju proteina (i njihovih gena) kako bi se olakšala analiza velike propusnosti. STRING je baza poznatih i računalno predviđenih interakcija protein-protein iz interakcija združenih iz drugih (primarnih) baza podataka. Za obradu podataka korišteni su rezultati proteomičke analize objavljenih radova u području hepatotoksičnosti. Korišteni programi razvrstali su proteine prema njihovim funkcijama, procesu u kojima sudjeluju, položaju i putu u stanici, smjestili u izravne i neizravne funkcionalne asocijacije. Time je omogućena obrada rezultata proteomičke analize kroz dubinsku analizu komplementa svih njegovih proteina, proteoma jetre.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Temeljne medicinske znanosti, Farmacija, Biotehnologija u biomedicini (prirodno područje, biomedicina i zdravstvo, biotehničko područje)

POVEZANOST RADA