Naslov
Ispitivanja inhibicije dipeptidil peptidaze III metalnim dikationima
(Dipeptidyl peptidase III inhibition tests by metal dications)

Autori
Matić, Antonia ; Karačić, Zrinka ; Tomić, Antonija ; Brkić, Hrvoje ; Tomić, Sanja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Knjiga sažetaka - 18. Ružičkini dani: Danas znanost - Sutra industrija / Jukić, Ante - Zagreb : Osijek : Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI) ; Prehrambeno tehnološki fakultet Sveučilišta Josipa Jurja Strossmayera u Osijeku, 2020, 78-78

ISBN
978-953-6894-75-8

Skup
18. Ružičkini dani "Danas znanost - sutra industrija"

Mjesto i datum
Vukovar, Hrvatska, 16.09.2020. - 18.09.2020

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija

Ključne riječi
ljudska dipeptidil peptidaza III ; metalni dikationi ; apoenzim ; holoenzim
(human dipeptidyl peptidase III ; metal dications ; apoenzyme ; holoenzyme)

Sažetak
Od ranije je poznato da peptidaznu aktivnost ljudske dipeptidil peptidaze III (hDPP III) inhibira suvišak iona cinka [1]. Cilj ovog istraživanja je utvrditi utjecaje različitih koncentracija metalnih dikationa: Zn2+, Mn2+, Co2+ i Cu2+ na aktivnost hDPP III, te identificirati inhibitorsko vezno mjesto metala. Postojanje inhibitornog veznog mjesta metala pretpostavljeno je na temelju strukturne sličnosti aktivnog mjesta hDPP III i termolizina kod kojeg je već dokazano vezanje drugog iona metala u neposrednoj blizini katalitički aktivnog iona (PDB: 1LND), te opaženog smanjenja aktivnosti hDPP III pri višim koncentracijama cinka [1]. Inhibicija hDPP III metalnim dikationima ispitat će se eksperimentalnim i računalnim metodama. Za potrebe eksperimentalnih istraživanja pripremljen je apoenzim, a njegovom inkubacijom različitim koncentracijama metalnih otopina pripremit će se četiri skupine holoenzima. U tako pripremljenim uzorcima koncentracije metala određivat će se masenom spektrometrijom visoke rezolucije s induktivno spregnutom plazmom (HR-ICP-MS), te mikrokalorimetrijskim metodama (izotermalna titracijska kalorimetrija, ITC). Kinetičkim mjerenjima ispitat će se aktivnost holoenzima. Molekulsko dinamičkim simulacijama u kombinaciji s računima slobodne energije vezanja pojedinih metalnih iona i kvantno mehaničkim - molekulsko mehaničkim računima pokušat će se identificirati najpovoljniji položaj drugog metalnog iona u blizini aktivnog mjesta hDPP III. Rezultati ovih istraživanja trebali bi pružiti detaljnu submolekularnu sliku metalne ionske izmjene u hDPP III, otkriti položaj potencijalnog inhibitornog metalnog veznog mjesta u hDPP III i objasniti kako dodatni ion cinka utječe na vezanje i hidrolizu supstrata. [1] K. M. Fukasawa et al., Biochim Biophys Acta1 804 (2010) 2063.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA