Naslov
Računalno istraživanje mehanizma ireverzibilne inhibicije enzima monoamin-oksidaze B
(Computational investigation of the mechanism of the irreversible inhibition of the monoamine oxidase B enzyme)

Autori
Tandarić, Tana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.02

Godina
2021

Stranica
112

Mentor
Vianello, Robert

Ključne riječi
EVB simulacije ; ireverzibilna inhibicija enzima ; kvantna mehanika ; molekulska dinamika ; monoamin-oksidaza B ; računalna kemija ; reakcijski mehanizam
(computational chemistry ; enzyme ireversible inhibition ; EVB simulation ; molecular dyamics ; monoamine oxidase B ; quantum mehanics ; reaction mechanism)

Sažetak
Monoamin-oksidaza B (MAO B) je flavoenzim koji regulira razinu endogenih i egzogenih amina u organizmu, uključujući neurotransmitere u mozgu. Predstavlja glavnu farmakološku metu u terapiji Parkinsonove i Alzheimerove bolesti. U sklopu ove disertacije proučen je mehanizam inhibicije MAO B ireverzibilnim selektivnim propargilaminskim inhibitorima, razagilinom i selegilinom te njihovim derivatima desmetilselegilinom i N- metilrazagilinom. Kvantno-kemijskom analizom unutar klasternog modela pokazano je da se inhibicija odvija u tri koraka. U prvom koraku, koji određuje ukupnu brzinu reakcije, flavinski kofaktor odcjepljuje hidridni ion s α-metilenske skupine supstrata. Dobiveni reakcijski profili i konačna struktura inhibiranog enzima u skladu su s eksperimentalnim podacima. Predloženi mehanizam dodatno je okarakteriziran empirijskim pristupom teorije empirijske valentne veze (EVB), koji uključuje cjelokupnu strukturu promatranog enzima. Simulacijama molekulske dinamike (MD) ispitane su termodinamika vezanja te interakcije inhibitora s aminokiselinama u aktivnom mjestu. Ostvareni rezultati od velike su važnosti za razvoj novih i efikasnijih MAO B inhibitora za kliničku primjenu.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA