Pregled bibliografske jedinice broj: 1087880
Automatic brain extraction in Nissl-stained histological sections
Automatic brain extraction in Nissl-stained histological sections // MIPRO 2020 - 43rd International Convention: Proceedings / Skala, Karolj (ur.).
Rijeka: Hrvatska udruga za informacijsku i komunikacijsku tehnologiju, elektroniku i mikroelektroniku - MIPRO, 2020. str. 301-305 doi:10.23919/MIPRO48935.2020.9245220 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni)
CROSBI ID: 1087880 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Automatic brain extraction in Nissl-stained
histological sections
Autori
Smolčić, Tomislav ; Petković, Tomislav ; Škokić, Siniša
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Radovi u zbornicima skupova, cjeloviti rad (in extenso), znanstveni
Izvornik
MIPRO 2020 - 43rd International Convention: Proceedings
/ Skala, Karolj - Rijeka : Hrvatska udruga za informacijsku i komunikacijsku tehnologiju, elektroniku i mikroelektroniku - MIPRO, 2020, 301-305
Skup
43rd International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO 2020)
Mjesto i datum
Opatija, Hrvatska, 28.09.2020. - 02.10.2020
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija
Ključne riječi
brain segmentation ; anisotropic diffusion ; shape smoothing ; histology
Sažetak
A simple and robust algorithm for automatic segmentation of Nissl-stained histological brain images is presented. The algorithm preprocesses the input image with anisotropic diffusion filter prior to applying standard binary image manipulations to isolate the brain from the background. Shape smoothing filter is applied to mimic the common practice of human evaluators. The developed code is tested on histological sections of mouse brains and compared to manual segmentation results.
Izvorni jezik
Engleski
Znanstvena područja
Interdisciplinarne prirodne znanosti, Elektrotehnika
POVEZANOST RADA
Projekti:
--IP-2016-06-1892 - Multimodalni prikaz molekularnih zbivanja tijekom oporavka mišjeg mozga nakon ishemijskog oštećenja (RepairStroke) (Gajović, Srećko) ( CroRIS)
--KK.01.1.1.01.0007 - Eksperimentalna i klinička istraživanja hipoksijsko-ishemijskog oštećenja mozga u perinatalnoj i odrasloj dobi (ZCI Neuro) (Judaš, Miloš) ( CroRIS)
Ustanove:
Fakultet elektrotehnike i računarstva, Zagreb,
Medicinski fakultet, Zagreb
