Naslov
Multigenska karakterizacija izolata bakterije 'Candidatus Phytoplasma asteris' iz uljane repice (Brassica napus ssp. oleifera (DC.) Metzg.)
(Multigene characterization of ''Candidatus Phytoplasma asteris' isolate from oilseed rape (Brassica napus ssp. oleifera (DC.) Metzg.))

Autori
Biljana Glumac

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
30.09

Godina
2019

Stranica
41

Mentor
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
fitoplazma, uljana repica, 16S rRNA, filogenetska analiza
(phytoplasma, rapeseed, 16S rRNA, phylogenetic analysis)

Sažetak
Fitoplazme (rod 'Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez stanične stijenke koje parazitiraju u floemu biljaka i stanicama kukaca te ih nije moguće uzgajati u čistoj kulturi in vitro. Fitoplazme imaju iznimno reducirane genome (680 - 1600 kb) i nedostaju im mnogi esencijalni geni za različite metaboličke putove. U svom životnom ciklusu obavezno izmjenjuju dva domaćina – biljku i kukca koji je ujedno i vektor. Dok kod kukaca najčešće ne izazivaju nikakve smetnje, njihov učinak na biljke je često vrlo štetan. U biljkama se zadržavaju unutar floema što im osigurava unos potrebnih metabolita za preživljavanje i umnažanje. Bolesti proliferacije uljane repice često se povezuju se s infekcijom unutarstaničnim fitogenim bakterijama roda 'Candidatus Phytoplasma'. Budući da ove bakterije nije moguće uzgojiti u čistoj kulturi in vitro, dokaz prisutnosti bazira se isključivo na molekularnim metodama. Stoga je cilj ovog diplomskog rada bila identifikacija te multigenskaa tipizacija izolata fitoplazme 'Ca. P. asteris' dobivenih iz simptomatičnih uzoraka uljane repice prikupljenih u Zagrebu na eksperimentalnom zemjištu Agronomskog fakulteta. Zarazu fitoplazmatskom vrstom 'Ca. P. asteris' dokazala sam PCR/RFLP analizom gena za 16S rRNA, a filogenetska analiza fitoplazmatskog gena za 16S rDNA iz izolata simptomatične uljane repice potvrdila je rezultate PCR/RFLP klasifikacije te pripadnost vrsti 'Ca. P. asteris' kao i u prethodno identificiranim fitoplazmama na istom domaćinu. Analiza još tri genska lokusa izvan 16S rRNA gena nije samo potvrdila pripadnost podskupini I-B ribosomske skupine Aster Yellows i vrsti 'Ca. P. asteris', nego je po prvi puta pružila i detaljnu molekularnu karakterizaciju nekog izolata fitoplazme iz uljane repice.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA