Naslov
Izgradnja filogenetskog stabla korištenjem metoda temeljenih na obilježjima taksona
(Phylogenetic Tree Construction using Maximum Parsimony and Maximum Likelihood)

Autori
Milisavljević, Alexandra

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Fakultet elektrotehnike i računarstva

Mjesto
Zagreb

Datum
02.07

Godina
2019

Stranica
35

Mentor
Domazet-Lošo, Mirjana

Ključne riječi
filogenetsko stablo ; takson ; metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena ; metoda najveće izglednosti
(phylogenetic tree ; taxon ; maximum parsimony ; maximum likelihood)

Sažetak
Metode izgradnje filogenetskog stabla temeljene na obilježjima taksona određuju međusobne odnose taksona, odnosno vrsta, promatrajući njihove morfološke ili molekularne razlike. Te metode daju preciznije rezultate od metoda temeljenih na udaljenostima taksona. Metoda najmanjeg broja evolucijskih promjena se vodi načelom Occamove oštrice, odnosno stablo koje zahtijeva najmanje promjena je najvjerojatnije da će se dogoditi. Druga metoda je metoda najveće izglednosti koja se temelji na probabilističkom modelu evolucije. Dodajući jedan po jedan takson u stablo se određuje koja topologija stabla je najizglednija. Nakon implementacije algoritama provedeno je testiranje na genomu virusa HIV-1 te su dobiveni rezultati uspoređeni s rezultatima već postojećih alata.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Računarstvo

POVEZANOST RADA