Pretraga

Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1004825

Bioinformatička reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uključenih u patogenezu aortne stenoze

Zeljko, Martina; Gošev, Igor; Počanić, Darko; Kozmar, Damir; Vujanić, Darko; Legčević, Zoran; Bešić, Dino; Paić, Frane
Bioinformatička reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uključenih u patogenezu aortne stenoze // Cardiologia croatica, 11 (2016), 12; 636-637 doi:10.15836/ccar2016.636 (recenziran, kratko priopcenje, znanstveni)

CROSBI ID: 1004825 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Bioinformatička reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uključenih u patogenezu aortne stenoze
(Bioinformatic reanalysis of gene expression microarray data reveals a number of previously unrecognized lncRNAs implicated in the pathogenesis of aortic stenosis)

Autori
Zeljko, Martina ; Gošev, Igor ; Počanić, Darko ; Kozmar, Damir ; Vujanić, Darko ; Legčević, Zoran ; Bešić, Dino ; Paić, Frane

Izvornik
Cardiologia croatica (1848-543X) 11 (2016), 12; 636-637

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Radovi u časopisima, kratko priopcenje, znanstveni

Ključne riječi
aortna stenoza, lncRNA, bioinformatička analiza
(aortic valve stenosis, lncRNA, bioinformatic analysis)

Sažetak
Uvod: Duge nekodirajuće RNA (lncRNAs) molekule, odnosno nekodirajuće RNA veće od 200 nukleotida, tvore heterogenu skupinu regulatornih RNA molekula koja pored ostalog obuhvaća intergenske lncRNA, antisens lncRNA transkripte i eRNA (enhancer lncRNA) molekule. S obzirom na sposobnost moduliranja stanične miR/ mRNA mreže i strukture kromatina terapijski potencijal lncRNA izrazito je velik te otvara mogućnosti za razvoj novih strategija liječenja u kardiovaskularnoj medicini. Nedavne studije pokazuju da promjene u ekspresiji i funkciji lncRNA igraju važnu ulogu u razvoju i progresiji aortne stenoze (AS) i AS-inducirane hipertrofije srca. Međutim, naše znanje o lncRNA diferencijalno izraženima u stenozom tkivu aortalnih zalistaka ili tijekom AS-inducirane srčane fibroze i remodeliranja miokarda ograničeno je tek na nekoliko primjera.1 Metode: Bioinformatička reanaliza dosad objavljenih ekspresijskih podataka dobivenih obradom postoperativnih uzoraka AS pacijenata te kontrolnih, patološki nepromijenjenih uzoraka aortalnih zalistaka izvršena je uporabom mrežnog programa DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery) v6.8. Rezultati: Osim lncRNA, MALAT1 i H19 sa već poznatom ulogom u osteogenoj transdiferencijaciji valvularnih intersticijskih stanica tijekom kalcifikacije aortalnih zalistaka, bioinformatička reanaliza otkrila je nekoliko prethodno neprepoznatih intergenskih, intronskih i antisens lncRNA molekula različito izraženih u stenotičkim zalistcima AS pacijenata u odnosu na kontrolno, patološki nepromijenjeno tkivo aortalnih zalistaka (slika 1). Zaključak: Bioinformatička analiza ekspresijskih studija u kombinaciji s novim, dorađenim podacima o nukleotidnom slijedu humanog genoma predstavlja koristan alat za otkrivanje prethodno neprepoznatih lncRNA transkripata upletenih u nastanak i razvoj aortalne stenoze.

Izvorni jezik
Hrvatski



POVEZANOST RADA

Profili:

Avatar Url Darko Počanić (autor)

Avatar Url Frane Paić (autor)

Poveznice na cjeloviti tekst rada:

doi www.kardio.hr

Citiraj ovu publikaciju:

Zeljko, Martina; Gošev, Igor; Počanić, Darko; Kozmar, Damir; Vujanić, Darko; Legčević, Zoran; Bešić, Dino; Paić, Frane
Bioinformatička reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uključenih u patogenezu aortne stenoze // Cardiologia croatica, 11 (2016), 12; 636-637 doi:10.15836/ccar2016.636 (recenziran, kratko priopcenje, znanstveni)
Zeljko, M., Gošev, I., Počanić, D., Kozmar, D., Vujanić, D., Legčević, Z., Bešić, D. & Paić, F. (2016) Bioinformatička reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uključenih u patogenezu aortne stenoze. Cardiologia croatica, 11 (12), 636-637 doi:10.15836/ccar2016.636.
@article{article, author = {Zeljko, Martina and Go\v{s}ev, Igor and Po\v{c}ani\'{c}, Darko and Kozmar, Damir and Vujani\'{c}, Darko and Leg\v{c}evi\'{c}, Zoran and Be\v{s}i\'{c}, Dino and Pai\'{c}, Frane}, year = {2016}, pages = {636-637}, DOI = {10.15836/ccar2016.636}, keywords = {aortna stenoza, lncRNA, bioinformati\v{c}ka analiza}, journal = {Cardiologia croatica}, doi = {10.15836/ccar2016.636}, volume = {11}, number = {12}, issn = {1848-543X}, title = {Bioinformati\v{c}ka reanaliza ekspresijskih podataka otkriva niz prethodno neprepoznatih lncRNA uklju\v{c}enih u patogenezu aortne stenoze}, keyword = {aortna stenoza, lncRNA, bioinformati\v{c}ka analiza} }
@article{article, author = {Zeljko, Martina and Go\v{s}ev, Igor and Po\v{c}ani\'{c}, Darko and Kozmar, Damir and Vujani\'{c}, Darko and Leg\v{c}evi\'{c}, Zoran and Be\v{s}i\'{c}, Dino and Pai\'{c}, Frane}, year = {2016}, pages = {636-637}, DOI = {10.15836/ccar2016.636}, keywords = {aortic valve stenosis, lncRNA, bioinformatic analysis}, journal = {Cardiologia croatica}, doi = {10.15836/ccar2016.636}, volume = {11}, number = {12}, issn = {1848-543X}, title = {Bioinformatic reanalysis of gene expression microarray data reveals a number of previously unrecognized lncRNAs implicated in the pathogenesis of aortic stenosis}, keyword = {aortic valve stenosis, lncRNA, bioinformatic analysis} }

Časopis indeksira:


  • Scopus

Citati:

    Altmetrijski pokazatelji:


    Podijeli:





    Contrast
    Increase Font
    Decrease Font
    Dyslexic Font
    CROSBI koristi kolačiće (cookies) kako bi poboljšao funkcionalnost stranice.