hrvatski

Varijabilnost gena rplF i tufB izolata fitoplazme flavescence dorée – uzročnika bolesti žutica vinove loze

Fitoplazme (rod 'Candidatus Phytoplasma') su bakterije bez stanične stijenke izrazito reduciranih genoma koje parazitiraju u floemu biljaka i stanicama kukaca, a nije ih moguće uzgajati u čistoj kulturi in vitro. Uzrokuju velik broj ekonomski značajnih bolesti biljaka u cijelom svijetu među kojima su i žutice vinove loze. Svrstane su u razred Mollicutes unutar kojeg tvore veliku monofiletsku grupu. Prenose se kukcima-vektorima iz reda Hemiptera koji se hrane floemom te zaraženim sadnim materijalom. Postoje dvije fitoplazmatske vrste koje su većinski uzročnici žutica vinove loze u Europi: flavescence dorée (FD) i bois noir (BN ; Candidatus 'Phytoplasma solani'). Cilj ovog diplomskog rada bio je tipizacija izolata fitoplazme FD analizom konstitutivnih gena rplF (gen za 50S ribosomski protein L6) i tufB (gen za elongacijski faktor EF-Tu) koji do sada nisu korišteni kao molekularni markeri u multigenskoj tipizaciji ove fitoplazmatske vrste. U analizu su uključeni uzorci vinove loze i biljaka iz okoline vinograda, kao i kukaca-vektora, prethodno prikupljeni na lokacijama na području čitave kontinentalne Hrvatske i Istarske županije. Fragmenti gena rplF i tufB umnoženi su lančanom reakcijom polimerazom te sekvencirani. Sravnjivanjem i filogenetskom analizom dobivenih nukleotidnih sljedova gena rplF i tufB utvrđeno je postojanje 5, odnosno 6 različitih genotipova među analiziranim uzorcima. Gen rplF se pokazao konzerviranijim od gena tufB, ali su se zbog svoje varijabilnosti oba pokazala kao potencijalno dobri kandidati za dodatne molekularne markere u tipizaciji fitoplazme FD.

žutice vinove loze, FD fitoplazma, MLST, tufB, rplF, filogenetska analiza

nije evidentirano