hrvatski

Prvo nacionalno istraživanje epigejske raznolikosti Malacostraca u slatkim i bočatim vodama Hrvatske temeljeno na DNA barkodiranju

Naše istraživanje na temelju DNA barkodiranja je rezultiralo s prvom pouzdanom procjenom raznolikosti i endemizma razreda Malacostraca u općenito ugroženim epigejskim slatkovodnim ekosustavima u Hrvatskoj. U istraživanju je analiziran materijal sakupljen na 196 lokaliteta koji uključuju izvore, potoke, rijeke i jezera širom Hrvatske. Ukupno je dobiveno 764 COI sekvenci od 47 morfoloških vrsta iz redova Amphipoda, Isopoda, Mysida i Decapoda. Sekvence su učitane u Barcode of Life Database (BOLD) kako bi im se dodijelili indentifikatori poznati kao Barcode Index Numbers (BIN-ovi). Prepoznali smo 80 BIN-ova od kojih je 58 bilo unikatno (nisu zabilježeni u BOLD sustavu). Amphipoda dominiraju u analiziranom materijali s obzirom na broj jedinki (404 sekvence u BOLD sustavu) i na broj rodova. Red Isopoda je zastupljen s 202 sekvence, red Decapoda sa 108 sekvenci i red Mysida s 50 sekvenci. Izvanredna genska varijabilnost je zabilježena u kompleksu vrsta Gammarus fossarum, s brojnim BIN-ovima endemičnim za Hrvatsku. Kompleksnu evolucijsku povijest G. fossarum Hrvatskoj povezuje se s razvojem središnjeg Paratetisa tijekom Neogena. Ovakva povijest diversifikacije je u prethodnim istraživanjim uočena kod kompleksa vrsta Gammarus balcanicus u Hrvatskoj. U ovom istraživanju smo zabilježili nove BIN-ove za G. balcanicus. Dobiveni podaci potvrđuju veliku skrivenu raznolikost faune epigejskih Malacostraca u Hrvatskoj i potrebu za detaljnijim istraživanjima ove grupe organizama. (We provide a first reliable assessment of malacostracan diversity and endemism in the generally endangered epigean freshwater ecosystems in Croatia based on the country-scale DNA barcoding survey. The survey included material from 196 localities in springs, streams, rivers and lakes all over Croatia. In total, 764 COI sequences for 47 morphospecies of Amphipoda, Isopoda, Mysida and Decapoda were successfully obtained during the study and submitted to Barcode of Life Database (BOLD) to receive the identifiers, known as Barcode Index Numbers (BINs). We have recognized 80 BINs out of which 58 are unique (not reported before). Amphipods dominated in the analysed material both in terms of number of individuals (404 sequences in BOLD) and the number of genera. Isopods are represented by 202 sequences, order Decapoda by 108 sequences, and order Mysida by 50 sequences. An outstanding genetic variability was detected in Gammarus fossarum species complex, showing numerous BINs endemic for Croatia. This result highlights a complex evolutionary history of G. fossarum in Croatia related to the development of the Central Paratethys basin in Neogene. This history of diversification is shared by Gammarus balcanicus species complex from the country, for which current study provided new BINs. The obtained data confirmed the high level of hidden diversity of epigean malacostracan fauna in Croatia. However, analyses revealed severe gaps in available genetic barcode data on some groups of Malacostraca.)

Amphipoda, Isopoda, Decapoda, Mysida

nije evidentirano