Uspostava referentnog panela SSCP profila za analizu gena DRB skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti jelena (Cervus elaphus) (CROSBI ID 419439)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Radović, Tihana
Galov, Ana ; Šeruga Musić, Martina
Arbanasić, Haidi
hrvatski
Uspostava referentnog panela SSCP profila za analizu gena DRB skupine II glavnog sustava tkivne podudarnosti jelena (Cervus elaphus)
Imunološko prepoznavanje vlastitog od stranog djelomično je kontrolirano setom gena unutar glavnog sustava tkivne podudarnosti (MHC). Ti geni kodiraju sustav membranskih glikoproteinskih receptora čija je glavna uloga prepoznati strane proteine, prezentirati ih specijaliziranim imunosnim stanicama, te pokrenuti imunološki odgovor. Veća varijabilnost genskih lokusa MHC omogućuje prepoznavanje šireg spektra antigena, pa posljedično i bolju obranu od patogena. Istraživanja varijabilnosti MHC lokusa analizom sekvenci fragmenata DNA umnoženih PCR reakcijom, obično uključuju i molekularno kloniranje. Uvođenjem metode SSCP (single strand conformation polymorphism), postupak utvrđivanja genske varijabilnosti bio bi jednostavniji, brži i jeftiniji smanjujući potrebu za molekularnim kloniranjem i dodatnim sekvenciranjem. U ovom istraživanju, po prvi puta u Hrvatskoj, uvela sam metodu SSCP u istraživanje raznolikosti alela lokusa DRB, te uspostavila referentni panel SSCP profila spomenutih alela u jelena (Cervus elaphus). U ispitivanim uzorcima utvrdila sam postojanje ukupno sedam različitih alela, te postojanje dupliciranog lokusa DRB. Na referentnom panelu, svaki od pojedinačnh alela pokazuje jedinstven SSCP profil, ali utvrđeno je i preklapanje pojedinih vrpci različitih alela. Kod nekoliko odabranih uzoraka, analiza SSCP izravno umnoženih fragmenata alela potvrdila je rezultate dobivene molekularnim kloniranjem i sekvenciranjem. No, za rutinsku uporabu SSCP panela u procjeni imunogenetičke varijabilnosti jelena u Hrvatskoj, trebalo bi metodu dodatno optimizirati i unaprijediti.
jelen, MHC, polimorfizam, DRB, SSCP, Hrvatska
nije evidentirano
engleski
ESTABILISHMENT OF SSCP PROFILE REFERENCE PANEL FOR ANALYSIS OF THE MAJOR HISTOCOMPATIBILITY COMPLEX CLASS II DRB GENE IN THE RED DEER (Cervus elaphus)
nije evidentirano
red deer, MHC, polymorphism, DRB, SSCP, Croatia
nije evidentirano
Podaci o izdanju
42
19.02.2018.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb