hrvatski

Izrada sržnih kolekcija hrvatskih genetskih izvora graha

Cilj istraživanja bio je analizirati genetsku raznolikost i strukturu 299 primki graha u svrhu izrade sržnih kolekcija hrvatskih genetskih izvora graha. Sržne su kolekcije uspostavljene pomoću dva algoritma (PowerCore i MSTRAT) koji koriste maksimizacijsku (M) strategiju na temelju rezultata genetske analize pomoću 26 mikrosatelitnih biljega. Analize skupina na temelju matrice udaljenosti kao i na temelju modela ukazale su na postojanje triju skupina u skladu s rezultatima analize tipa fazeolina. Primke graha su svrstane u 10 skupina koje predstavljaju najčešće morfotipove (tradicijske kultivare) u Hrvatskoj, te u miješanu skupinu manje zastupljenih morfotipova. Utvrđeno je postojanje 245 jedinstvenih genotipova. Sržna kolekcija odabrana upotrebom algoritma PowerCore sastojala se od 40 genotipova predstavljajući tako najmanji podskup primki u kojem su sadržani svi aleli zapaženi u cjelokupnoj kolekciji. Algoritmom MSTRAT utvrđen je podskup od 20 genotipova koji je imao nesignifikantno manje alelno bogatstvo u odnosu na cjelokupnu kolekciju. Maksimiziranjem genetske raznolikosti u reduciranom skupu genotipova, sržna kolekcija od 20 primki će olakšati buduća istraživanja raznolikosti graha upotrebom fenotipizacije visoke propusnosti kao i genotipizacije pomoću sekvenciranja nove generacije.

sržna kolekcija, grah, tradicijski kultivari, mikrosatelitni biljezi

nije evidentirano

engleski

Development of core collections of Croatian common bean genetic resources

Cilj istraživanja bio je analizirati genetsku raznolikost i strukturu 299 primki graha u svrhu izrade sržnih kolekcija hrvatskih genetskih izvora graha. Sržne su kolekcije uspostavljene pomoću dva algoritma (PowerCore i MSTRAT) koji koriste maksimizacijsku (M) strategiju na temelju rezultata genetske analize pomoću 26 mikrosatelitnih biljega. Analize skupina na temelju matrice udaljenosti kao i na temelju modela ukazale su na postojanje triju skupina u skladu s rezultatima analize tipa fazeolina. Primke graha su svrstane u 10 skupina koje predstavljaju najčešće morfotipove (tradicijske kultivare) u Hrvatskoj, te u miješanu skupinu manje zastupljenih morfotipova. Utvrđeno je postojanje 245 jedinstvenih genotipova. Sržna kolekcija odabrana upotrebom algoritma PowerCore sastojala se od 40 genotipova predstavljajući tako najmanji podskup primki u kojem su sadržani svi aleli zapaženi u cjelokupnoj kolekciji. Algoritmom MSTRAT utvrđen je podskup od 20 genotipova koji je imao nesignifikantno manje alelno bogatstvo u odnosu na cjelokupnu kolekciju. Maksimiziranjem genetske raznolikosti u reduciranom skupu genotipova, sržna kolekcija od 20 primki će olakšati buduća istraživanja raznolikosti graha upotrebom fenotipizacije visoke propusnosti kao i genotipizacije pomoću sekvenciranja nove generacije.

core collection, common bean, landraces, microsatellite markers

nije evidentirano