hrvatski

Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze

Usporedba struktura periodičnosti višeg reda alfa satelita u DNK sekvenci čovjeka, neandertalca i čimpanze - izrada baze podataka globalnih mapa U genomu čovjeka alfa sateliti su jedne od najzastupljenijih DNK periodičnosti, u obliku tandema ili periodičnosti višega reda – HOR-ova, te zauzimaju oko 5% cjelokupnog ljudskog genoma. Alfa sateliti u čovjeka su uvelike proučavani zbog svoje funkcionalne i strukturalne uloge u centromeri, koja je bitna za segregaciju kromosoma u mitozi i mejozi, sparivanju s homolognim kromosomima, formiranju kinetohornih struktura itd. .. Alfa sateliti su također pogodni i za proučavanje evolucije kao rezultat usklađene evolucije (concerted evolution) – procesa u kojemu su paralogne sekvence sličnije unutar iste vrste nego kod svojih srodnih vrsta, bez obzira što su se duplikacije prethodile procesu specijacije. Pomoću naše računalne metode Global Repeat Map – GRM razvijenene u našoj grupi , kao rezultat naših prethodnih istraživanja alfa satelita 3 , stvorili smo bazu podataka u sklopu novog projekta u koju smo pohranili sve identicirane sekvence alfa satelita iz genoma čovjeka, čimpanze te nedavno sekvencioniranog genoma neandertalca, naše bliske izumrle vrste. Iz analiziranih alfa satelita možemo zaključivati da li postoje razlike ili sličnosti u kromosomima u njihovim pripadajućim HOR strukturama između ove tri vrste, razlike u broju monomera koji tvore HOR-ove, divergencijama između konsenzusa. Svi prikupljeni podaci iz tih analiza, pošto se za alfa satelite u čovjeka smatra da su nedavno dodane u obliku periodičnosti višega reda u genom, dati će nam tragove o njihovim mogućim razlikama u njihovoj funkcionalnosti u ove tri proučavane vrste proučavanjem CENP-B box pJ distribucije motiva u njima.

periodičnosti višega reda, sateliti, čovjek, čimpanza , neandertalac, genom

nije evidentirano