hrvatski

Ekspresija i identifikacija novih proteina djelomično neuređene tercijarne strukture (IDP) iz biljke uročnjak (Arabidopsis thaliana) nakon izlaganja abiotičkom stresu

Nativno neuređeni proteini (engl. intrinsically disordered proteins, IDP) pripadaju nedavno priznatoj skupini proteina koji su biološki aktivni usprkos nedostatku jasno definirane tercijarne strukture. Takvi proteini često su adapterske ili signalne molekule i šaperoni. Smatra se da imaju važnu ulogu u odgovoru biljaka na stres, no o tome nema mnogo podataka. Od velike je važnosti razjasniti molekularne mehanizme odgovora na stres jer on značajno ograničava rast i prinos industrijskih biljaka. Cilj ovog istraživanja bio je analizirati ekspresiju i identificirati IDP u biljci uročnjaku Arabidopsis thaliana nakon izlaganja hladnoći. Globularni proteini eliminirani su zagrijavanjem uzoraka na 99 °C. IDP i ostali globularni proteini razdvojeni su nativnom i denaturirajućom 2D PAGE s 8M urejom. U biljaka tretiranih hladnoćom, denzitometrijska analiza ukazala je na izostanak ekspresije 10 proteina, smanjenje ekspresije jednog i povećanje ekspresije četiri proteina u odnosu na kontrolu. Masenom spektrometrijom identificirano je 29 različitih proteina unutar 40 proteinskih mrlja. Bioinformatičkim alatom PrDOS za procjenu neuređenosti proteina na osnovi analiza primarne strukture otkriveno je 13 novih IDP. Analizom prema rječniku Gene Ontology pokazano je da većina proteina sudjeluje u abiotičkom stresu vezivanjem različitih bioloških molekula, kao što su DNA, RNA i proteini. Kao prvo istraživanje IDP u proteomu biljnog organizma ovaj rad je značajan za čitavo područje IDP.

adapterske molekule, šaperoni, procjenitelji neuređenosti, stres hladnoća

nije evidentirano